시료 모터가 안착되는 시료 모터 안착 지그;상기 시료 모터 안착 지그에 상하 방향 구동력을 제공하는 Z축 구동부;시료 모터와 부하 모터 사이에 장착되어 토크를 감지하는 토크 센서;상기 시료 모터의 진동을 감지하는 진동 센서; 및상기 토크 센서 및 진동 센서 중 적어도 하나로부터 신호를 수집하고 수집된 신호를 주파수 영역으로 퓨리에 변환하여 축 정렬 상태를 감지하고 상기 감지된 축 정렬 상태에 따라 상기 Z축 구동부를 제어하는 축 정렬 조정부를 포함하고,상기 축 정렬 조정부는,상기 토크 센서 및 진동 센서 중 적어도 하나로부터 시간 영역의 토크 신호 및 진동 신호 중 적어도 하나를 수집하는 신호 수집부,상기 토크 신호 및 진동 신호 중 적어도 하나의 신호를 주파수 영역으로 퓨리에 변환하는 퓨리에 변환부,상기 퓨리에 변환된 데이터에 대해 기본파와 고조파를 추출하고 상기 기본파의 크기, 상기 고조파의 주파수 및 상기 고조파의 크기를 기반으로 축 정렬 상태 및 축 체결 상태를 분석하는 분석부 및 상기 축 정렬 상태 및 축 체결 상태 분석 결과에 따라 상기 고조파의 크기가 감소되도록 상기 Z축 구동부를 제어하는 구동 제어부를 포함하고,상기 분석부는, 상기 고조파의 주파수가 상기 기본파의 주파수의 정수배이고 상기 고조파의 크기가 상기 기본파의 크기의 임계치 % 이상이면 축 정렬 상태 불량으로 결정하고, 상기 고조파의 주파수가 상기 기본파의 주파수의 정수배가 아닌 소수배이고 상기 고조파의 크기가 기설정된 한계치를 초과하면 축 체결 상태 불량으로 결정하며,상기 구동 제어부는 상기 분석부가 축 체결 상태 불량으로 결정한 경우 작업자에게 알람하는,것을 특징으로 하는 모터 다이나모미터의 축 정렬 장치.