본 발명의 하나의 실시예에 따른 자가 줄기세포 자가 배양 방법은, (a) 의료기관에 의해 채취된 자신의 줄기세포 및 제1 배양액이 수용된 제1 배양용기를 의료기관으로부터 자신의 배양장치에 수용하는 단계; (b) 줄기세포의 배양에 적합한 환경이 조성되도록 배양장치를 제어하는 단계; (c) 배양장치의 제1 배양용기 내에서 배양되는 줄기세포를 관찰하는 단계; (d) 제1 배양용기 내의 제1 배양액을 교체하는 단계; (e) 제1 배양용기 내에서 배양된 줄기세포를 분할하는 단계; 및 (f) 분할된 줄기세포를 제2 배양액과 함께 제2 배양용기에 수용하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다. 이에 의해, 개인이 자신의 줄기세포를 스스로 배양함으로써, 획기적으로 비용을 절감할 수 있고, 자신의 줄기세포가 타인의 줄기세포와 바뀌는 것을 원천적으로 방지할 수 있으며, 자신의 줄기세포 배양에 최적화된 환경을 제공할 수 있게 된다.