NCT-TREX를 사용한 암 진단 마커 및 예후 예측용 마커
Biomarkers for Diagnosing and Predicting Prognosis of Cancer Using NCT-TREX
특허 요약
본 발명은 NCT-TREX를 사용한 암 진단 마커 및 예후 예측용 마커에 관한 것으로, 보다 상세하게는 핵 세포질 수송(nuclear cytoplasmic transport; NCT) 중 핵공 복합체(nuclear pore complexes; NPC) 및 TREX(TRanscription and EXport) 복합체의 모듈화(NCT-TREX) 분석을 통해 NCT-TREX가 여러 암종에서 매우 특이적인 패턴을 보이는 것을 발견하였고 이를 암 진단 마커 및 예후 예측용 마커에 활용하는 것이다. 본 발명의 모듈화된 NCT 복합체 및 TREX 복합체를 포함하는 암 진단 마커 및 예후 예측용 마커는 단일 유전자 각각에 대한 발현 수준을 분석하는 건이 아닌, 유전자 집합 접근법 및 알고리즘을 이용하여 유전체 전체를 분석한 뒤, NCT 및 TREX 복합체를 구성하는 물질 전체의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 모듈화(modularity)화여 분석하는 것으로, 핵공 복합체와 같이 발현 수준의 변화가 미세한 유전자 그룹의 분석에 적합한 장점이 있다. 본 발명의 NCT- TREX 복합체를 모듈화하여 정상조직, 원발성 및 전이암 각각을 분석한 결과, 원발성 및 전이암에서 NCT-TREX 전체 유전자의 발현이 정상조직에 비해 현저하게 증가하는 것을 확인하였다.
청구항
번호청구항
1

핵 세포질 수송(nuclear cytoplasmic transport; NCT) 관련 복합체 및 TREX (TRanscription and EXport) 복합체를 포함하는, 암 진단 마커 조성물.

2

제1항에 있어서, 상기 핵 세포질 수송 관련 복합체는 핵공 복합체(nuclear pore complexes; NPC)인 것을 특징으로 하는, 암 진단 마커 조성물.

3

제2항에 있어서, 상기 핵공 복합체의 구성요소는 NUP98, NUP62, NUP54, NUP58, NUP88, NUP210, POM121, NDC1, NUP153, NUP50, TPR, NUP205, NUP188, NUP155, NUP93, NUP35, NUP107, NUP160, NUP43, NUP37, AHCTF1, NUP133, NUP85, SEC13, SEH1L, AAAS, NUP214, RANBP2, NUPL2, GLE1 및 RAE1인 것을 특징으로 하는, 암 진단 마커 조성물.

4

제1항에 있어서, 상기 TREX 복합체의 구성요소는 THOC1, THOC2, THOC3, THOC5, THOC6, THOC7, DDX39A, DDX39B, ALYREF, FYTTD1, LUZP4, CHTOP, SARNP, POLDIP3, ZC3H11A 및 ERH인 것을 특징으로 하는, 암 진단 마커 조성물.

5

제1항에 있어서, 상기 암은 부신피질암, 폐암, 갑상선암, 담관암, 위암, 유방암, 난소암, 대장암, 치종암, 혈액암, 후두암, 식도암, 구강암, 기저세포암, 담도암, 직장암, 신장암, 간암, 뇌종양, 자궁암, 결장암, 방광암 및 췌장암으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 암 진단 마커 조성물.

6

핵 세포질 수송(nuclear cytoplasmic transport; NCT) 관련 복합체 및 TREX (TRanscription and EXport) 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 모듈화(modularity)화여 분석하는 단계를 포함하는, 암 진단을 위한 정보 제공방법.

7

제6항에 있어서, 상기 암 진단을 위한 정보 제공방법은, (a) 환자에 분리한 시료로부터 핵공 복합체(nuclear pore complexes; NPC) 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 모듈화(modularity)화여 평균값을 도출하는 단계;(b) 상기 평균 값을 대조군 시료의 NPC 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 평균 값과 비교하는 단계; 및 (c) 상기 NPC 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 평균 값이 대조군 시료보다 높을 경우, 암인 것으로 정보를 제공하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는, 암 진단을 위한 정보 제공방법.

8

핵 세포질 수송(nuclear cytoplasmic transport; NCT) 관련 복합체 및 TREX (TRanscription and EXport) 복합체를 포함하는, 암 예후 예측용 마커 조성물.

9

제8항에 있어서, 상기 핵 세포질 수송 관련 복합체는 핵공 복합체(nuclear pore complexes; NPC)인 것을 특징으로 하는, 암 예후 예측용 마커 조성물.

10

제9항에 있어서, 상기 핵공 복합체의 구성요소는 NUP98, NUP62, NUP54, NUP58, NUP88, NUP210, POM121, NDC1, NUP153, NUP50, TPR, NUP205, NUP188, NUP155, NUP93, NUP35, NUP107, NUP160, NUP43, NUP37, AHCTF1, NUP133, NUP85, SEC13, SEH1L, AAAS, NUP214, RANBP2, NUPL2, GLE1 및 RAE1인 것을 특징으로 하는, 암 예후 예측용 마커 조성물.

11

제8항에 있어서, 상기 TREX 복합체의 구성요소는 THOC1, THOC2, THOC3, THOC5, THOC6, THOC7, DDX39A, DDX39B, ALYREF, FYTTD1, LUZP4, CHTOP, SARNP, POLDIP3, ZC3H11A 및 ERH인 것을 특징으로 하는, 암 예후 예측용 마커 조성물.

12

제8항에 있어서, 상기 암은 부신피질암, 폐암, 갑상선암, 담관암, 위암, 유방암, 난소암, 대장암, 치종암, 혈액암, 후두암, 식도암, 구강암, 기저세포암, 담도암, 직장암, 신장암, 간암, 뇌종양, 자궁암, 결장암, 방광암 및 췌장암으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 암 예후 예측용 마커 조성물.

13

핵 세포질 수송(nuclear cytoplasmic transport; NCT) 관련 복합체 및 TREX (TRanscription and EXport) 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 모듈화(modularity)화여 분석하는 단계를 포함하는, 암 예후 예측을 위한 정보 제공방법.

14

제13항에 있어서, 상기 암 예후 예측을 위한 정보 제공방법은, (a) 환자에 분리한 시료로부터 핵공 복합체(nuclear pore complexes; NPC) 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 모듈화(modularity)화여 평균값을 도출하는 단계;(b) 상기 평균 값을 대조군 시료의 NPC 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 평균 값과 비교하는 단계; 및 (c) 상기 NPC 및 TREX 복합체를 구성하는 물질의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 평균 값이 대조군 시료보다 높을 경우, 무병생존율(overall free survival) 또는 무재발 생존율(recurrence free survival)이 낮을 것으로 예측하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는, 암 예후 예측을 위한 정보 제공방법.