유방암 호르몬 수용체의 상태 예측을 위한 바이오 마커
Biomarker for predicting the status of breast cancer hormone receptors
특허 요약
본 발명은 유방암 관련 호르몬 수용체의 상태를 예측하는 바이오 마커에 관한 것으로, AGR3, C1orf64, C4orf7, CLEC3A, SOX11, 및 TFF1로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나 이상과 ESR1을 포함하여 에스트로겐 수용체(estrogen receptor; ER)의 발현 상태를 예측하는 마커 제1군; AGR3, ESR1, NAT1, PVALB, 및 S100A7로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나 이상과 PGR을 포함하여 프로게스테론 수용체(progesterone receptor; PR)의 발현 상태를 예측하는 마커 제2군 및; CPB1, GSTT1, 및 PROM1로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나 이상과 ERBB2를 포함하여 인간 표피 성장인자 수용체 2(human epidermal growth factor receptor 2; HER2)의 발현 상태를 예측하는 마커 제3군;을 포함하는 유방암 호르몬 수용체 상태 예측용 바이오 마커 조성물을 제공한다.
청구항
번호청구항
8

제7항에 있어서, 상기 생물학적 시료는 유방암 조직, 유방암 전이 부위 조직, 및 이들의 조합을 포함하는 군에서 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 정보 제공 방법.

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AGR3, C1orf64, C4orf7, CLEC3A, SOX11, TFF1 및 ESR1을 포함하는 마커 제1군;AGR3, ESR1, NAT1, PVALB, S100A7 및 PGR을 포함하는 마커 제2군 및;CPB1, GSTT1, PROM1 및 ERBB2를 포함하는 마커 제3군;을 포함하는 유전자 발현 프로파일링(GEP)을 기반으로 한 유방암 호르몬 수용체 상태 예측용 바이오 마커 조성물.

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제1항에 있어서, 상기 유방암 호르몬 수용체 상태는 상기 마커 제1군, 마커 제2군및 마커 제3군에 포함된 유전자들의 유전자 발현량들의 조합적인 패턴으로 결정되는 것을 특징으로 하는 인 것을 특징으로 하는 바이오 마커 조성물.

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제1항에 있어서, 상기 마커 제1군은 에스트로겐 수용체(estrogen receptor; ER)의 발현 상태를 예측하는 용도인 것을 특징으로 하는 바이오 마커 조성물.

4

제1항에 있어서, 상기 마커 제2군은 프로게스테론 수용체(progesterone receptor; PR)의 발현 상태를 예측하는 용도인 것을 특징으로 하는 바이오 마커 조성물.

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제1항에 있어서, 상기 마커 제3군은 인간 표피 성장인자 수용체 2(human epidermal growth factor receptor 2; HER2)의 발현 상태를 예측하는 용도인 것을 특징으로 하는 바이오 마커 조성물.

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제1항에 있어서, 상기 바이오 마커 조성물은 유방암 환자의 호르몬 치료 유용성을 예측하기 위한 정보를 제공하는 것을 특징으로 하는 바이오 마커 조성물.

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유전자 발현 프로파일링(GEP)을 기반으로 유방암 호르몬 수용체 상태 예측에 필요한 정보 제공 방법으로서,환자의 생물학적 시료로부터 AGR3, C1orf64, C4orf7, CLEC3A, SOX11, TFF1 및 ESR1을 포함하는 마커 제1군;AGR3, ESR1, NAT1, PVALB, S100A7 및 PGR을 포함하는 마커 제2군 및;CPB1, GSTT1, PROM1 및 ERBB2를 포함하는 마커 제3군;의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 측정하는 단계;를 포함하고,상기 마커 제1군으로 에스트로겐 수용체(estrogen receptor; ER)의 발현 상태를 예측하고,상기 마커 제2군은 프로게스테론 수용체(progesterone receptor; PR)의 발현 상태를 예측하고,상기 마커 제3군은 인간 표피 성장인자 수용체 2(human epidermal growth factor receptor 2; HER2)의 발현 상태를 예측하는 것을 특징으로 하는 유전자 발현 프로파일링(GEP)을 기반으로 유방암 호르몬 수용체 상태 예측에 필요한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 mRNA 수준을 측정하는 방법은 역전사효소 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소반응(competitive RT-PCR), 실시간 역전사효소 중합효소반응(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection method), 노던 블랏팅(Northern blotting), DNA 칩 방법(DNA chip technology), 파이로 염기서열분석법 (pyrosequencing), 차세대 염기서열분석법(next generation sequencing, NGS), 생어 염기서열분석법(Sanger sequencing), 및 RNA 염기서열분석법(RNA- sequencing; RNA-seq)으로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 단백질의 수준을 측정하는 방법은 웨스턴 블랏(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbentassay), 방사선면역분석(RIA: radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radial immunodiffusion), 오우크테로니면역 확산법(Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동(rocket immunoelectrophoresis), 면역조직화학염색법(immunohistochemical staining), 면역침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complement Fixation Assay), 면역형광법(immunofluorescence), 면역크로마토그래피법(immunochromatography), FACS 분석법(fluorescenceactivated cell sorter analysis), 단백질 칩 방법(protein chip technology), 및 역상 단백질 어레이(reverse phase protein array; RPPA)로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 정보 제공 방법은 상기 에스트로겐 수용체(estrogen receptor; ER)의 발현 상태, 프로게스테론 수용체(progesterone receptor; PR)의 발현 상태 및 인간 표피 성장인자 수용체 2(human epidermal growth factor receptor 2; HER2)의 발현 상태를 조합하여 유방암 환자의 호르몬 치료 유용성을 예측하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 정보 제공 방법.

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