두경부암의 예후 예측을 위한 암 관련 섬유아세포의 바이오마커
Biomarkers in cancer associated fibroblasts for predicting prognosis of head and neck cancer
특허 요약
본 발명은 두경부암의 예후 예측을 위한 정보제공방법 및 두경부암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 등에 관한 것으로, 콜라겐 유전자 COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1의 발현이 증가한 암 관련 섬유아세포 (cancer associated fibroblasts)의 경우, 암을 촉진하는 것으로 알려진 통상의 CAF와 달리 오히려 암 세포의 침윤 및 성장을 억제한다는 것을 발견하여 완성된 것이다. 나아가, CAF에서 상기 콜라겐 유전자의 발현이 억제되면 CAF에 의한 암 침윤 촉진 효과가 증가하며, 상기 콜라겐 유전자들의 발현 수준 및 두경부암 환자의 예후간에 강력한 상관관계가 있다는 것이 확인되었다. 따라서, 본 발명에 따른 CAF의 콜라겐 유전자 COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1를 활용하여 두경부암의 예후를 높은 정확도로 예측할 수 있을 뿐만 아니라, 암세포의 침윤 및 전이를 억제하여 두경부암을 효과적으로 치료할 수 있을 것으로 기대된다.
청구항
번호청구항
1

두경부암의 예후 예측을 위한 정보제공방법으로서,(S1) 피검체로부터 분리된 생물학적 시료에서 COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준을 측정하는 단계; 및(S2) 상기 단계 (S1)에서 측정된 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준이 대조군에 비해 감소되어 있는지 확인하는 단계를 포함하고,상기 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준이 감소되어 있는 경우, 두경부암의 예후가 좋지 않은 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

2

제1항에 있어서,상기 생물학적 시료는 혈액, 전혈, 혈장, 소변, 타액, 조직, 세포, 기관, 골수, 미세침흡인 검체, 중심부바늘생검(core needle biopsy) 검체 및 진공흡입생검 검체로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

3

제2항에 있어서,상기 조직은 종양 기질 (tumor stroma)인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

4

제2항에 있어서,상기 세포는 암 관련 섬유아세포 (cancer associated fibroblast)인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

5

제1항에 있어서,상기 대조군은 정상인 또는 비전이성 두경부암 환자로부터 분리된 생물학적 시료인 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

6

제1항에 있어서,상기 단백질 수준은 웨스턴 블랏, ELISA, 방사선면역분석, 방사선 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법(Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동(Rocket immunoelectrophoresis), 면역염색법, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, 질량분석법(Mass spectrometry), FACS, 및 단백질칩으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

7

제1항에 있어서,상기 mRNA 수준은 PCR, RNase 보호 분석법, 노던 블랏팅(northern blotting), 서던 블랏팅(southern blotting), In situ 교잡법, DNA 칩, 및 RNA 칩으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.

8

두경부암 치료 물질의 스크리닝 방법으로서,(S1) 두경부암 환자로부터 분리된 생물학적 시료에 시험물질을 처리하는 단계; (S2) 상기 시험물질을 처리한 시료와 처리하지 않은 대조군 시료에서 COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준; 또는 콜라겐 단백질의 활성 정도를 측정하는 단계; 및(S3) 대조군 시료와 비교해 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준; 또는 콜라겐 단백질의 활성 정도를 증가시킨 시험물질을 두경부암 치료 물질로 선별하는 단계를 포함하는, 스크리닝 방법.

9

COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준을 측정하는 제제를 유효성분으로 포함하는 두경부암의 예후 예측용 조성물로서, 상기 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준이 감소되어 있는 경우, 두경부암의 예후가 좋지 않은 것으로 판단하는, 예후 예측용 조성물.

10

제9항에 있어서,상기 mRNA 수준을 측정하는 제제는 상기 mRNA에 특이적으로 결합하는 프라이머 세트 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 예후 예측용 조성물.

11

제9항에 있어서,상기 단백질 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는, 예후 예측용 조성물.

12

제9항 내지 제11항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는, 두경부암의 예후 예측용 키트로서,상기 키트는 하기 두경부암의 예후 예측 방법이 기재된 설명서를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 예후 예측용 키트:(S1) 피검체로부터 분리된 생물학적 시료에서 COL3A1, COL6A6, COL25A1, 및 COL26A1로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준을 측정하는 단계; 및(S2) 상기 단계 (S1)에서 측정된 콜라겐 유전자의 mRNA 또는 단백질 수준이 대조군에 비해 감소되어 있는 경우, 두경부암의 예후가 좋지 않은 것으로 판단하는 단계.

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