수박 왜성 개체 선발용 신규 유전자 마커 및 이의 이용
Novel genetic markers for selection of watermelon dwarf entities and use thereof
특허 요약
본 발명은 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 신규 유전자 마커 및 이의 이용에 관한 것으로서, 보다 구체적으로는 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 SNP(single nucleotide polymorphism) 마커 조성물, 프라이머 세트, 및 키트와 이를 이용하여 수박 왜성 개체를 판별하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 수박 왜성 유전자 마커의 제공으로, 왜성 계통 및 품종 개발시 어린 식물체 또는 종자의 DNA를 추출하여 빠르고 간편하게 왜성 유무를 확인할 수 있게되어 왜성을 나타내는 수박 품종의 효율적 판별 및 육성이 가능해 지므로, 육종에 소요되는 시간, 비용, 및 노력을 절감하는데 매우 유용할 것으로 기대된다.
청구항
번호청구항
1

서열번호 1의 염기서열 내에서 501번째 염기에 위치하는 SNP(single nucleotide polymorphism)를 포함하는 8 내지 100개의 연속적인 염기로 구성되는 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열; 및서열번호 2의 염기서열 내에서 501번째 염기에 위치하는 SNP를 포함하는 8 내지 100개의 연속적인 염기로 구성되는 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 수박 왜성(dwarf) 개체를 판별하기 위한 SNP 마커 조성물.

2

제1항에 있어서, 상기 SNP 마커 조성물은 수박의 유전자 마커 이용 여교잡(Marker-assisted backcross, MABC)에 적용하는 것을 특징으로 하는, 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 SNP 마커 조성물.

3

서열번호 1의 501번째 염기, 또는 서열번호 2의 501번째 염기를 포함하는 8 내지 100개의 연속된 염기서열 또는 이의 상보적인 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오타이드에 특이적으로 결합하는, 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 프라이머 세트.

4

제3항에 있어서,상기 프라이머 세트는, 서열번호 3 및 4로 이루어진 프라이머 세트; 및서열번호 5 및 6으로 이루어진 프라이머 세트로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 프라이머 세트를 포함하는, 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 프라이머 세트.

5

제3항 또는 제4항에 있어서, 상기 프라이머 세트는 고해상도 융해(High-resolution melting; HRM) 분석용 프라이머 세트인 것을 특징으로 하는, 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 프라이머 세트.

6

제3항 또는 제4항의 프라이머 세트를 포함하는, 수박 왜성 개체를 판별하기 위한 키트.

7

하기의 단계를 포함하는, 수박 왜성 개체를 판별하는 방법:(a) 판별하고자 하는 수박으로부터 유전체(genomic) DNA를 분리하는 단계;(b) 분리된 상기 유전체 DNA에서, 서열번호 1의 501번째 염기, 또는 서열번호 2의 501번째 염기 타입을 검출하는 단계; 및(c) 상기 검출한 염기 타입으로부터 수박 왜성 개체를 판별하는 단계.

8

제7항에 있어서,상기 (b) 단계는 제3항의 프라이머 세트를 이용하여 PCR(polymerase chain reaction)을 수행하는 것을 특징으로 하는, 수박 왜성 개체를 판별하는 방법.

9

제7항에 있어서,상기 (c) 단계는 고해상도 융해, 모세관 전기영동, DNA 칩, 겔-전기영동, 서열분석, 방사선 측정, 형광 측정, 및 인광 측정으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법으로 수행되는 것을 특징으로 하는, 수박 왜성 개체를 판별하는 방법.