CTCF매개 전사체 응축 촉진용 조성물
Composition for promoting CTCF-mediated transcript condensation
특허 요약
본 발명은 전사체 응축 촉진용 조성물의 스크리닝 방법 및 전사체 응축 결핍 유전 질환의 진단용 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 CTCF(CCCTC-binding factor) 단백질이 유전자의 전사 과정 전체의 효율을 결정하는 전사 응축물 형성에 대한 양의 조절자 역할을 한다는 새로운 발견에 기반하여, CTCF의 활성화를 통해 전사체 응축 결핍 및 이로 인한 유전자 발현 효율 저하를 원인으로 하는 다양한 유전질환에 대해 근원적인 치료제 조성물로 유용하게 이용될 수 있다.
청구항
번호청구항
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다음의 단계를 포함하는 전사체 응축(transcriptional condensates) 촉진용 조성물의 스크리닝 방법:(a) 세포를 포함하는 생물적 시료에서 CTCF 단백질의 발현, 및 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현을 측정하는 단계;(b) 상기 시료에 옥신을 처리하는 단계;(c) 상기 시료에서 CTCF 단백질의 발현 감소와 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현 유지를 확인하는 단계;(d) 상기 시료에 전사체 응축 촉진용 후보물질을 접촉시키는 단계;(e) 상기 시료에서 CTCF 단백질의 발현 증가와 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현 유지를 확인하는 단계; 및(f) 상기 후보물질을 전사체 응축 촉진용 조성물로 판정하는 단계.

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제 1 항에 있어서, 상기 CTCF를 발현하는 세포는 상피세포(Glandular epithelial cells), 내분비세포(Endocrine cells), 신경세포(Neuronal cells), 신경아교세포(Glial cells), 생식세포(Germ cells), 영양막세포(Trophoblast cells), 내피세포(Endothelial cells), 근육세포(Muscle cells), 지방세포(Adipocytes), 색소세포(Pigment cells), 중간엽세포(Mesenchymal cells), 혈액세포(Blood cells) 및 면역세포(immune cells)로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.

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제 1항에 있어서, 상기 방법은,상기 (b) 단계에 의해 MED1 및 BRD4의 2차원(2D-focal plane) 클러스터 수가 감소되는 것인, 방법.

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제 1항에 있어서, 상기 방법은,상기 (d) 단계에 의해 MED1 및 BRD4의 2차원(2D-focal plane) 클러스터 수가 증가되는 것인, 방법.

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다음의 단계를 포함하는 전사체 응축(transcriptional condensates) 결핍 유전 질환의 예방 또는 치료용 조성물의 스크리닝 방법:(a) 세포를 포함하는 생물적 시료에서 CTCF 단백질의 발현, 및 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현을 측정하는 단계;(b) 상기 시료에 옥신을 처리하는 단계;(c) 상기 시료에서 CTCF 단백질의 발현 감소와 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현 유지를 확인하는 단계;(d) 상기 시료에 전사체 응축 촉진용 후보물질을 접촉시키는 단계;(e) 상기 시료에서 CTCF 단백질의 발현 증가와 RPB1, MED1 및 BRD4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 단백질의 발현 유지를 확인하는 단계; 및(f) 상기 후보물질을 전사체 응축 결핍 유전 질환의 예방 또는 치료용 조성물로 판정하는 단계.여기서, 상기 전사체 응축 결핍 유전 질환은 루빈스타인-테이비 증후군(Rubinstein-Taybi syndrome), 코핀-시리스 증후군(Coffin-Siris syndrome), 코넬리아드랑게 증후군(Cornelia de Lange), CHOPS 증후군(CHOPS syndromes) 및 레트 증후군(Rett syndrome)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나이다.

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제 5항에 있어서, 상기 CTCF를 발현하는 세포는 상피세포(Glandular epithelial cells), 내분비세포(Endocrine cells), 신경세포(Neuronal cells), 신경아교세포(Glial cells), 생식세포(Germ cells), 영양막세포(Trophoblast cells), 내피세포(Endothelial cells), 근육세포(Muscle cells), 지방세포(Adipocytes), 색소세포(Pigment cells), 중간엽세포(Mesenchymal cells), 혈액세포(Blood cells) 및 면역세포(immune cells)로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.

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제 5항에 있어서, 상기 방법은,상기 (b) 단계에 의해 MED1 및 BRD4의 2차원(2D-focal plane) 클러스터 수가 감소되는 것인, 방법.

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제 5항에 있어서, 상기 방법은,상기 (d) 단계에 의해 MED1 및 BRD4의 2차원(2D-focal plane) 클러스터 수가 증가되는 것인, 방법.

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