단일세포전사체 데이터에서 핵심 차등발현 유전자를 발굴하는 MarcoPolo 알고리즘 개발

2023과학기술정보통신부개인기초연구(과기정통부)
프로젝트 소개
본 과제는 단일세포 전사체 데이터에서 핵심 차등발현 유전자를 찾는 알고리즘 MarcoPolo 개발 연구임. 기존 방법이 클러스터링 결과에 의존하는 한계를 보완하여, 데이터 자체로 마커 유전자를 객관적으로 발굴하는 것이 목적임. 연구 내용은 쌍봉분포, 유전자간 연관성, 주성분 공간상 분산을 활용한 비모수통계량 개발과 이를 결합한 MarcoPolo 프로토타입 구현, 다양한 scRNA 데이터 적용 및 기존 방법과의 비교, MarcoPCA 개발과 소프트웨어 최적화 및 공개로 구성됨. 이를 통해 단일세포전사체 분석의 정확도 향상, 질병 기전 이해 증진, 유전체 생물정보학 경쟁력 확보, 인류 건강 증진 효과가 기대됨.
단일세포전사체차등발현유전자마커유전자클러스터링네트워크알고리즘Single Cell RNADifferentially expressed geneMarker geneClusteringNetworkAlgorithm
참여형태
주관
사업명
개인기초연구(과기정통부)
부처명
과학기술정보통신부
주관기관명
서울대학
과제 수행연도
2023
과제 수행기간
2022.03.01 ~ 2025.02.28
과제 고유번호
1711190731
연구 개발단계
기초연구
연구비
총연구비
148,927,000
정부지원연구개발비
148,927,000
위탁연구비
0
민간연구비
0
주관/협동기관 정보
주관/협동수행기관명연구수행주체지역
주관서울대학대학서울특별시
과제 기반 국내외 특허0건
출원/등록 기관발명의 명칭출원일자출원국가출원번호등록일자등록번호
과제 기반 SCI(E) 논문0건
논문명학술지명DOI/URL