심장의 수축과 이완에는 심장전도계에서 전기적 자극이 필요함. 심장전도계의 시작점인 굴심방결절의 주된 세포인 박동조율세포 기능 이상은 심부전 발생의 위험인자로 간주됨. 본 연구실은 박동조율세포의 미토콘드리아 표적 제어인자를 발굴하여 심부전의 발생과 진행을 감소시키고자 함- 1차년도 : 심부전 동물모델에서 박동조율세포 미토콘드리아 표적 발굴- 2차년도 : 신규...
심부전
미토콘드리아
심장박동
굴심방결절
다중오믹스
2
2023년 2월-2028년 2월
|116,874,000원
구조기반 가상 약물 스크리닝과 기계학습을 이용한 미토콘드리아 표적 항암제 개발
미토콘드리아 내 에너지 대사의 주요 표적인 glutamate dehyrogenase(GDH) 효소의 “구조기반 가상 약물 스크리닝(structure-based virtual screening, SBVS)”으로 강력한 항암 효능이 있는 저해제와 “기계학습(machine learning)”을 이용하여 효능 높은 항암 펩타이드(anticancer peptides...
글루타메이드 디하이드로게나제
항암 펩타이드
구조기반 가상 약물 스크리닝
기계학습
저해제
3
2023년 2월-2028년 2월
|116,874,000원
구조기반 가상 약물 스크리닝과 기계학습을 이용한 미토콘드리아 표적 항암제 개발
미토콘드리아 내 에너지 대사의 주요 표적인 glutamate dehyrogenase(GDH) 효소의 “구조기반 가상 약물 스크리닝(structure-based virtual screening, SBVS)”으로 강력한 항암 효능이 있는 저해제와 “기계학습(machine learning)”을 이용하여 효능 높은 항암 펩타이드(anticancer peptides...
글루타메이드 디하이드로게나제
항암 펩타이드
구조기반 가상 약물 스크리닝
기계학습
저해제
4
2023년 2월-2028년 2월
|105,187,000원
구조기반 가상 약물 스크리닝과 기계학습을 이용한 미토콘드리아 표적 항암제 개발
미토콘드리아 내 에너지 대사의 주요 표적인 glutamate dehyrogenase(GDH) 효소의 “구조기반 가상 약물 스크리닝(structure-based virtual screening, SBVS)”으로 강력한 항암 효능이 있는 저해제와 “기계학습(machine learning)”을 이용하여 효능 높은 항암 펩타이드(anticancer peptides...
글루타메이드 디하이드로게나제
항암 펩타이드
구조기반 가상 약물 스크리닝
기계학습
저해제
통합오믹스
대사체학
5
주관|
2020년 6월-2023년 2월
|375,000,000원
미토콘드리아 표적 초미세먼지 독성제어 연구실
1. 초미세먼지 독성 저감을 위한 다중오믹스와 기계학습을 이용한 기전 분석과 선도 물질 확보
? 선행연구에서 도출한 초미세먼지 독성 저감 물질로 심장세포에서의 유효성 분석 (미토콘드리아 활성화와 exocytosis를 중심으로)
? 미토콘드리아 활성화를 조절하는 핵심 요소 발굴 {α-Amino-β-carboxymuconate-ε-semialdehyde Decarboxylase (ACMSD) Inhibitor, methy pyurvate, glutamate dehydrogenase (GDH) activator 기타}
? 초미세성분 독성 저감 후보물질의 심장세포에서의 다중오믹스(전사체, 단백체, 대사체)로 기전과 효능 분석
- 전사체: NGS 분석(3회 반복 분석)
- 단백체; Tandem mass tag (TMT)으로 표지하여 Orbitrap fusion lumos tribrid mass spectrometer를 이용하여 펩타이드 질량 분석 (4,000 종류의 단백질 분석)
- 대사체: GC/MS/MS로 에너지 대사에 관련된 대사체류 (아미노산, 유기산, 유리지방산)의 profiling과 bioinformatics 기반 network 분석
? 초미세먼지 독성 저감 후보 물질들의 효능을 다중오믹스 big data를 Ingenuity Pathway Analysis (IPA) program과 기계학습 알고리즘으로 single network를 구축하여, 약물의 작용점 예측과 효과 기전 분석
2. 초미세먼지에 의한 미토콘드리아 손상 분자 기전 규명과 미토콘드리아 기능저하 동물모델을 활용한 신규물질들의 미토콘드리아 활성화 유효성 검증
? 초미세먼지의 미토콘드리아 독성 표적 규명
? 심장질환, 미토콘드리아 기능저하 동물모델을 이용한 신규 물질들의 미토콘드리아 활성화 유효성 규명
3. 초미세먼지 자극에 의한 심근세포 수축능 및 형태학적 변화 관찰. 선도 물질이 심장 미토콘드리아 손상과 심부전 발생에 미치는 예방 효과 규명
? 초미세먼지 유발 심장질환 모델 제작
? 심장질환 모델을 이용한 신규물질들의 유효성 검증
4. 초미세먼지 독성 저감을 위한 미토콘드리아의 GDH activator의 in silico 분석 후 선도 물질 제시