이온 이동도 분광법-질량분석법(IMS-MS)과 초고전하(슈퍼차지) 전기분무 이온화(supercharging electrospray ionization; ESI)를 결합한 기법은 단백질의 화학적 토폴로지를 효과적으로 구별할 수 있음을 입증하였다. 초고전하 ESI를 통해 단백질에 가능한 한 많은 전하를 도입하면 단백질 사슬이 대체로 펼쳐지고 신장되어, 숨겨진 화학적 토폴로지가 드러난다. 서로 다른 화학적 토폴로지는 순환 도메인에서의 비틀림(토셔널) 회전 제한으로 인해 펼쳐진 단백질의 기하학적 크기가 다르게 나타난다. 사슬-길이 정규화 충돌 단면적(chain-length-normalized collision cross-section; CCS)과 광범위하게 펼쳐진 상태에서의 최대 전하 상태(maximum charge state; z M )와 같은 새로운 토폴로지 지표를 도입함으로써, 선형 사슬, 고리(링)를 포함하는 토폴로지(라소, 테드폴, 다중고리 등), 그리고 카테네인(catenanes)과 같은 기계적으로 맞물린 고리까지 다양한 단백질 화학적 토폴로지를 성공적으로 구별할 수 있었다.

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