본 과제의 최종 목표는 국내 미기록/신종 섬모충류에 대한 통합적 분류체계를 확립함으로써, 이모류에 대한 기초자료를 체계화하고 국가 생물종 목록의 과학적 정합성과 생물다양성 데이터베이스의 질적 향상을 도모하는 데 있음. 아울러 석/박 통합 과정 동안 축적한 이모류 분류 경험과 기술을 집약하여 학위논문과 국제 학술지 게재를 마무리하고 이후 분류학 기반 생물다양...
계통분류학
형태학
이모섬모충류
생물다양성
신종
2
2023년 7월-2025년 12월
|86,000,000원
최신의 통합 분류학적 연구를 통한 기생성 섬모충류의 감염 진단가이드 개발
기생성 섬모충류는 수계에서 다양한 숙주생물에 질병을 일으켜 양식 산업뿐 아니라 생태계 및 다른 생물의 진화에도 지대한 영향을 미치나 이들은 자유생활 섬모충류에 비해 훨씬 덜 주목을 받아왔다. 하지만 최근 연구에 따르면 그 다양성은 엄청날 것으로 예측되고 있다. 그러나, 많은 기생성 섬모충류를 동정할 수 있는 정보가 부족하여 그 식별이 어려운 실정이다. 또한...
생물다양성
진단 가이드
기생성 섬모충
조직병리학
계통분류
3
2023년 7월-2025년 12월
|86,000,000원
최신의 통합 분류학적 연구를 통한 기생성 섬모충류의 감염 진단가이드 개발
기생성 섬모충류는 수계에서 다양한 숙주생물에 질병을 일으켜 양식 산업뿐 아니라 생태계 및 다른 생물의 진화에도 지대한 영향을 미치나 이들은 자유생활 섬모충류에 비해 훨씬 덜 주목을 받아왔다. 하지만 최근 연구에 따르면 그 다양성은 엄청날 것으로 예측되고 있다. 그러나, 많은 기생성 섬모충류를 동정할 수 있는 정보가 부족하여 그 식별이 어려운 실정이다. 또한...
생물다양성
진단 가이드
기생성 섬모충
조직병리학
계통분류
4
주관|
2023년 7월-2025년 12월
|42,532,000원
최신의 통합 분류학적 연구를 통한 기생성 섬모충류의 감염 진단가이드 개발
최종 목표를 달성하기 위하여 다음과 같은 내용의 연구가 그에 해당하는 방법으로 수행될 것이다.
① 기생성 섬모충류의 형태기재와 종 다양성 분석: 다양한 수서 숙주동물에서 기생성 섬모충류를 채집하고 서식환경과 함께 최신의 방법으로 그들의 형태자료를 분석하여 분류학적 혼동과 오류를 해결하고 종 다양성을 밝힌다.
② 숙주의 조직병리학적 분석: 다양한 숙주 생물에 대하여 기생성 섬모충류의 침입률, 밀도 및 침투부위를 조사한다. 감염된 숙주의 상태 및 임상 증상(예: 과형성, 조직병리학적 병변, 무기력)을 모니터링하여 기생성 종에 의해 유발된 유해성을 확인한다. 기생충의 숙주 특이성도 확인한다.
③ 세포 발생의 형태발생 분석: 계통적으로 중요한 의의를 가진 종에 대해서, 필요한 경우세포분열 과정의 피질 구조와 핵의 패턴 형성, 새로운 구조의 분화, proter-opisthe에서 오래된 세포구조의 운명 등에 대한 자료에 중점을 두어 분석한다.
④ 분자 데이터베이스 구축 및 분석: 대상 종에서 마커 유전자 [리보좀 유전자 (SSU rRNA, ITS, LSU rRNA 유전자)와 미토콘드리아 유전자(COI, mtSSU)]를 시퀀싱하고, 계통적으로 필요한 경우에 단일세포 유전체 및/또는 전사체를 시퀀싱한다. 오믹스(omics) 분석으로 기생적응 유전자 후보를 선별(screening)한다. 분자 데이터는 GenBank에 제출한다.
⑤ 통합 분류학적 분석과 계통분류체계의 개선: 획득한 분자자료, 형태학적 특성, 숙주 및 서식지 정보를 바탕으로 계통적 관계가 불명확한 분류군에 대해 최신의 통합 분류학적 분석을 수행하여 계통적 위치를 결정하고 진화적 관계를 규명하여 섬모충류의 분류체계를 개선한다.
⑥ 가이드북 작성: 이상에서 밝혀진 기생성 섬모충류의 형태학적 특성, 유전자마커, 숙주의 조직병리학 자료, 서식환경등의 정보가 포함된 기생성 섬모충류에 대한 진단 가이드를 작성한다.
섬모충류는 소핵 전장유전체 자료가 부족해 계통·종 구분이 어려운 단세포 진핵생물로, 본 과제는 이모섬모충류의 과 수준 계통과 Spirostomum속 종 경계를 유전체로 재구명하는 연구임.
연구목표는 비교유전체 분석(comparative phylogenomic analyses)과 전장 유전체 assembly를 통해 계통진화 가설을 통합 제시함이며, 핵심 연구내용은 5차에 걸쳐 표본 동정, 10개 과 전장유전체 assembly 완성, MSA 및 Concatenation- & Coalescent- based phylogenomic analyses로 가설 검증, gene family·유전자군 네트워크 및 key innovations 분석, Spirostomum속 종 경계 명확화 수행임. 기대효과는 NGS 기반 유전체 수준 사례 축적, 신종·미기록 종 발굴과 자생 섬모충류 관리, 다른 분류군의 종 구분에도 활용 가능함.