조직 재생은 다양한 세포 계층과 상태에 의해 매개되는 다단계 과정이며, 이는 또한 조직 기능장애와 병인에 연루되어 있다. 본 연구에서는 단일세포 RNA 시퀀싱을 생체 내 계통추적(in vivo lineage tracing) 및 오가노이드 모델과 결합하여, 손상 복구와 폐 재생 과정에서 폐포 계통 세포의 궤적을 정밀하게 지도화하였다. 우리는 폐포 재생 동안 나타나는 독특한 AT2 계통 세포 집단인 손상 관련 일과성 전구세포(damage-associated transient progenitors, DATPs)를 확인하였다. 또한 간질성 대식세포 유래 IL-1β가 Il1r1을 발현하는 AT2 세포의 일부 집단을 HIF1α 매개 해당과정(glycolysis) 경로를 통해 DATPs로 전환되도록 선행(prime)하며, 이 과정이 성숙한 AT1 세포로의 분화에 필요함을 발견하였다. 특히, IL-1β에 의해 매개되는 만성 염증은 AT1 분화를 억제하여 DATPs의 비정상적 축적과 폐포 재생의 손상을 초래하였다. 종합하면, 이러한 단계적 세포 운명 전환에 대한 지도화는 염증성 미세환경이 줄기세포의 운명과 행동을 조절함으로써 폐포 재생을 어떻게 제어하는지 보여준다.

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