박현규 교수 연구실
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다중 miRNA 검출용 나노바이오칩·형광 신호 플랫폼 연구

Nanobiochip and fluorescence signal platforms for multiplex miRNA detection

연구 내용

miRNA 표적에 의해 방출되는 형광 신호와 전사 구동형 fluorogenic RNA aptamer를 활용해 다중 miRNA를 정확히 정량하는 검출 시스템을 개발하는 연구

다중 miRNA를 한 번에 정량하기 위해 신호 단위를 분리하고 조합하는 접근을 사용합니다. polychromatic quantum dot array 기반 패턴을 제작한 뒤, DSN(duplex-specific nuclease) 반응으로 miRNA에 특이적으로 형광 양자점 프로파일을 방출시켜 community signal ensemble로 판독합니다. 또한 target-triggered transcription으로 multicolor fluorogenic RNA aptamer의 반응을 유도하여 miRNA 표적에 따른 색상 조합 신호를 구성합니다. 이러한 설계는 동적 범위와 정밀도를 함께 고려한 판독 구조를 제공하는 데 목적이 있습니다.

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연구 흐름

초기에는 miRNA 표적-반응 관계를 형광 신호로 전환하는 반응 설계를 중심으로 접근했습니다. 이후 quantum dot의 다색 패턴을 구성하고, DSN 기반 방출 메커니즘을 결합하여 multiplex 판독이 가능한 신호 조합 구조를 구현했습니다. 다음 단계에서는 multicolor fluorogenic RNA aptamer를 이용해 transcription 기반의 target-triggered 신호 증폭을 확장하고, one-step에 가까운 검출 흐름에서 신호 해석이 가능하도록 구성을 정교화했습니다. 최근까지 miRNA 프로파일링을 암 관련 진단 실증 방향으로 연결하는 연구를 수행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • 다중 miRNA 진단 패널
  • DSN 기반 신호 방출 시스템
  • Quantum dot 패턴형 판독
  • fluorogenic RNA aptamer 리포터
  • transcription 구동형 검출 모듈
  • 다색 형광 신호 해석
  • 나노패턴 전사 기반 칩 제작
  • femtomolar 급 정량용 프로토콜
  • 암 관련 miRNA 프로파일링
  • 정밀 multiplex 판독 알고리즘

관련 논문

구분

제목

1

Polychromatic Quantum Dot Array to Compose a Community Signal Ensemble for Multiplexed miRNA Detection

2

Multiplexed miRNA detection based on target-triggered transcription of multicolor fluorogenic RNA aptamers

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