요점 우리는 정상 및 노화된 신장을 포함한 다양한 조직으로부터 단일세포 장비(長非編碼 RNA) 아틀라스를 구축하였다. 우리는 신장 세포에서 장비(長非編碼 RNA)의 연령 및 세포 유형 특이적 발현 변화들을 확인하였다. 배경 축적된 근거는 장비(長非編碼 RNA, lncRNA)가 세포 분화와 항상성(homeostasis)을 조절하며, 그 결과 신장 노화와 질병에 영향을 미친다는 것을 보여준다. 이처럼 다기능적임에도 불구하고, 다양한 세포 유형에서의 lncRNA 전사체(transcriptome)에 대한 기준 지도(reference map)가 부족하여 lncRNA의 기능은 여전히 충분히 규명되지 않았다. 방법 본 연구에서는 표적 단일세포 RNA 시퀀싱(single-cell RNA sequencing) 방법을 사용하여 개별 세포에서 lncRNA를 농축하고 특성화하였다. 우리는 정상 및 노화된 신장을 포함한 다양한 마우스 조직에 이 방법을 적용하였다. 결과 조직 특이적 군집 분석을 통해, 알려진 세포 유형 마커 유전자들과 높은 상관관계를 보이는 세포 유형 특이적 lncRNA를 확인하였다. 또한 각 세포 유형에서 차등 발현된 lncRNA의 기능적 역할을 탐색하기 위해 유전자 조절 네트워크(gene regulatory networks)를 구축하였다. 신장에서 우리는 노화 동안 lncRNA의 발현이 역동적으로 변화하는 양상을 관찰하였으며, 특히 사구체(glomerular) 세포에서의 변화가 두드러졌다. 이러한 세포 유형 및 연령 특이적 lncRNA 발현 패턴은 lncRNA가 신장 노화 동안 면역 반응과 에너지 대사(energy metabolism)와 같은 세포 과정들을 조절하는 데 잠재적 역할을 할 수 있음을 시사한다. 결론 본 연구는 lncRNA 발현과 기능의 종합적 지형을 조명하고, 향후 lncRNA 분석을 위한 유용한 자원을 제공한다(https://gist-fgl.github.io/sc-lncrna-atlas/).

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