한성규 교수 연구실
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연구 분야
프로젝트
논문
구성원
article|
인용수 8
·2023
Tissue-specific and tissue-agnostic effects of genome sequence variation modulating blood pressure
Dongwon Lee, Seong Kyu Han, Or Yaacov, Hanna Berk-Rauch, Prabhu Mathiyalagan, Santhi K. Ganesh, Aravinda Chakravarti
IF 7.5 (2023) Cell Reports
초록

전장 유전체 연관 연구(genome-wide association studies, GWASs)는 다유전자성 형질과 질병과 연관된 수많은 변이를 확인해 왔다. 그러나 몇 가지 예외를 제외하면, 특정 변이가 어떤 조직에서 어떤 유전자를 어떻게 조절하여 형질 변이를 조절하는지에 대한 기전적 이해는 부족한 실정이다. 본 연구에서는 GWAS, 서로 다른 조직으로부터의 멀티오믹스 데이터, 그리고 기계 학습 접근법을 활용하여 전사 조절(transcriptional regulation)의 유전학을 통해 혈압(BP)의 형질 유전가능성을 설명하고자 하는 유전체 분석을 제시한다. 네 개의 조직에서 예측된 약 50만 개의 조절 변이는 변이 유전가능성의 33.4%를 설명하며, 신장-, 부신-, 심장-, 동맥 특이적 변이에 대해 각각 2.5%, 5.3%, 7.7%, 11.8%를 나타낸다. 관련된 강화자(enhancer)에서의 변이는 이들이 조절하는 유전자에서의 변이보다 더 큰 조직 특이성을 보였는데, 이는 혈압의 표현형과 관련된 조직에서 강화자 변이에 의해 교란되는 유전자 조절 네트워크가 개인 간 변이의 주요 원천임을 시사한다. 따라서 본 연구는 특정 형질에 대해 인간의 조직과 세포 유형이 생리적으로 기여하는 정도를 탐색하기 위한 접근법을 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
BiologyEnhancerGenome-wide association studyHeritabilityQuantitative trait locusGeneticsPhenotypeGenetic associationGeneGenetic variation
타입
article
IF / 인용수
7.5 / 8
게재 연도
2023

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