한성규 교수 연구실
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논문
구성원
article|
인용수 2
·2025
T‐CLASS: An Online Tool for the Identification and Classification of Aging and Senescence Using Transcriptome Data
Seung‐Chul J. Lee, Seung‐Chul J. Lee, Gee‐Yoon Lee, Sieun S. Kim, Yunkyu Bae, Seokjin Ham, Jooyeon Sohn, Seong Kyu Han, Seung‐Jae Lee, Seung‐Jae Lee
IF 7.1 (2025) Aging Cell
초록

전사체(transcriptome) 분석은 노화 연구에서 점점 더 널리 활용되고 있다. 그러나 전사체 데이터로부터 노화 과정과 장수(longevity) 증진 요법을 좌우하는 핵심 분자적 변화들을 규명하는 일은 여전히 어렵다. 본 연구에서는 전사체 기반 시그니처 상태(Signature States)에 대한 적응 학습(Adaptive learning)으로 분류하는 Transcriptomic CLassification via Adaptive learning of Signature States (T-CLASS)를 제시한다. T-CLASS는 온라인 도구로서, 전사체 데이터로부터 수백 개 유전자로 구성된 유전자 세트(gene sets)를 식별하며, 이는 장수와 노화 패러다임을 최적으로 대표한다. 우리는 Caenorhabditis elegans에서의 장수 증진 요법, 배양 마우스 1차 세포 및 배양 인간 세포에서 서로 다른 방식으로 유도한 세포 노화(cellular senescence), 그리고 인간 근감소증(human sarcopenia)을 포함하는 다양한 데이터셋을 대상으로 T-CLASS의 효과를 체계적으로 평가하였다. 그 결과 T-CLASS는 기존의 사전 존재하는 기계/딥러닝 기반 유전자 선택 도구들과 비교하여 데이터셋 전반에서 견고하고 높은 분류 성능을 보였다. 이후 C. elegans에서의 장수 증진 요법에 분석을 집중한 결과, T-CLASS는 수명 연장(lifespan-extending) 소분자 10종이 유발한 전사체 변화를 성공적으로 분류했으며, 그중 rifampicin과 atracurium의 효과를 원리 입증(proof of principle)을 위해 실험적으로 검증하였다. 종합하면, T-CLASS는 노화에 영향을 미치는 유전적 및 약리학적 중재가 초래하는 생리적 변화를 규명하고 분류하는 데 효과적이고 실용적인 도구이다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
TranscriptomeBiologyLongevitySenescenceIdentification (biology)Computational biologyCaenorhabditis elegansGeneBioinformaticsGenetics
타입
article
IF / 인용수
7.1 / 2
게재 연도
2025

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