배경: 여성의 모계 계통 Jinbuol (JBO, early heading)과 두 개의 재조합 동형접합(iso-genic) 계통인 JSRIL1 및 JSRIL2는 논 재배 조건에서 각각 남성 모계 계통 Samgwang (SG, late heading)보다 44일, 34일, 16일 더 일찍 개화하는 것으로 나타났다. 목적: 이들 계통 간의 출수(heading) 차이에 광주기성 관련 유전자가 어떤 방식으로 관여하는지 탐색하고자 하였다. 방법: 심층 염기서열분석을 수행하였고, 광주기성 관련 유전자(71)를 범주화한 다음, 일부 핵심 유전자에 대해 qRT-PCR을 실시하였다. 결과: 심층 염기서열분석 결과, 부계군의 기여가 거의 균등했으며 JSRIL1과 JSRIL2에서 각각 모계 JBO로부터 유전된 염색체가 48.5%와 45%로 확인되었다. 그러나 Chr6에서는 편향된 모계 기여가 가장 컸고, 99.4%가 모계 JBO로부터 유전되었다. 쌀 GIGANTEA (OsGI), 알곡 수, 초장 및 출수일 7 (Ghd7), EARLY HEADING DATE 1 (Ehd1) 등 다수의 알려진 꽃 유도 유전자에서의 단일염기다형성(SNP) 변이는 매우 미미하였다. JSRIL들에서 HEADING DATE 1 (Hd1)과 VERNALIZATION INSENSITIVE 3-LIKE 1 (OsVIL2)은 JBO 유래인 반면, FLAVIN-BINDING, KELCH REPEAT, F BOX 1 (OsFKF1)은 SG 유래였다. 흥미롭게도 HEN1 억제인자 1 (OsHESO1)은 JSRIL1에서는 SG 유래, JSRIL2에서는 JBO 유래로 확인되었다. 화엽정(꽃 분열조직) 형성 단계의 식물에 대한 RNA sequencing 및 qRT‒PCR 분석 결과, 염색체 재구성과 전사 후 조절을 통한 전사 수준의 조절이 미세한 유전자 조절을 좌우하여 JSRIL에서 출수가 지연되는 원인이 될 수 있음을 시사하였다. 결론: 본 연구의 유전자 발현 및 SNP 분석을 통해 고품질 엘리트 재조합 동형접합 계통에서 쌀의 광주기성 관련 유전자가 어떻게 조절되는지 이해하는 데 도움이 될 수 있다.

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