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전장 유전체 기반 식물바이러스 분자특성 규명

Whole-genome sequencing-based molecular characterization of plant viruses

연구 내용

전장 유전체를 확보하고 ORF 및 단백질 조성을 분석하여 신규·국내 분포 식물바이러스를 분자 수준에서 규명하는 연구

연구는 식물 시료에서 바이러스 서열을 회수하고 전장 유전체를 완결하는 데 초점을 둡니다. 고처리량 염기서열분석 기반으로 바이러스 후보를 선별한 뒤, Sanger sequencing 등을 활용해 유전체 말단과 ORF 구성을 정밀하게 확정합니다. 이후 유전체 구조 비교와 단백질 서열(예: RNA polymerase, coat protein) 분석, 계통 유사성 평가를 수행하여 국내 분포 및 변이 양상을 정리합니다. 또한 씨전염 또는 구근 매개 가능성이 있는 바이러스에 대해 서열 정보를 기반으로 검역 및 무병 묘 생산에 필요한 기초 자료를 제공합니다.

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연구 흐름

초기에는 특정 작물·수종에서 확인되는 식물바이러스의 존재를 분자 진단으로 확인하고, 유전체 정보를 확보하는 절차를 정립했습니다. 이후 2022~2023년에는 전장 유전체를 중심으로 유전자 기능 추정과 유전체 구조를 정리하여, 국내 분포 또는 신규 동정 가능성을 분자 수준에서 제시하는 방향으로 연구가 확장되었습니다. 2023~2024년에는 병징 관련 수종(예: 구근·종자 전달 가능성이 거론되는 바이러스)으로 범위를 넓혀, 유전체 서열과 단백질 조성 분석을 병행하는 체계를 강화했습니다. 최근에는 확보된 서열 정보를 바탕으로 검역·무병 재배용 재료의 품질 확보에 활용 가능한 분석 프레임을 구축하는 연구를 수행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • 바이러스 전장 유전체 기반 진단 프로토콜
  • 진단 프라이머 및 프로브 설계
  • 계통분류 및 계통유사성 데이터베이스 구축
  • 재배 수종별 분자 마커 개발
  • 종자·구근 전달 가능성 판별 지원
  • 유전체 구조 기반 변이 추적 도구
  • 병징 관련 후보 유전자 기능 검증
  • 동일 바이러스의 지역별 변이 비교
  • 무병 묘·종자 생산 품질 관리 지표
  • 바이러스 혼입 위험도 평가 체계

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