Metatranscriptome-based plant virome and symptom-associated viral ecology
연구 내용
HTS와 네트워크 분석을 통해 작물별 바이롬 구성과 공동감염 패턴을 해석하여 병징과 연관된 바이러스 생태를 규명하는 연구
연구는 개별 식물 시료의 메타전사체 분석을 통해 바이러스 군집을 포괄적으로 규명하는 방식으로 수행됩니다. HTS 기반 데이터에서 바이러스 스펙트럼을 확보하고, 근접 채집 전략 및 삼자 네트워크 분석과 같은 정량적 구조 분석을 결합해 공동감염과 상호 연관성을 해석합니다. 병징이 동반된 개체군에서는 특정 지속성 바이러스의 존재 양상이 달라질 수 있음을 분리해서 평가하며, 유전체 가변성과 재조합 가능성에 대한 근거를 함께 정리합니다. 또한 RT-PCR 및 염기서열 확인을 통해 바이러스 발생 빈도와 감염 조합을 확정하여, 향후 무병 묘 생산과 재배지 관리에 활용할 수 있는 기초 자료를 제공합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
2편
관련 특허
0건
관련 프로젝트
2건
연구 흐름
초기에는 증상 의심 시료를 수집한 뒤 메타전사체 기반으로 바이러스 후보를 탐색하고, RT-PCR과 서열 확인으로 검출 정확도를 확보하는 절차를 마련했습니다. 이후 2023년에는 특정 과수·재배 작물에서 감염률과 단일/복합 감염 조합을 정리하는 방향으로 연구를 전개했습니다. 2024년에는 Cnidium officinale에서 왜소화 양상과 연결될 수 있는 지속성 바이러스 군집을 중심으로, 네트워크 기반 해석과 공동감염 역학을 심화했습니다. 최근에는 바이러스 군집이 식물 내 생태계로 기능하는 관점을 적용하여, 감염 조합과 변이 패턴을 기반으로 병 관리 전략 수립에 필요한 데이터 구조를 구축하고 있습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Deciphering the virome of Chunkung (Cnidium officinale) showing dwarfism-like symptoms via a high-throughput sequencing analysis
Metatranscriptome-Based Analysis of Viral Incidence in Jujube (Ziziphus jujuba) in Korea
관련 프로젝트
구분
제목
주요 밭작물 및 채소류의 고위험 문제바이러스 병해특성조사 및 조기 진단‧방제 정보 인벤토리 구축(3공동)
주요 밭작물 및 채소류의 고위험 문제바이러스 병해특성조사 및 조기 진단‧방제 정보 인벤토리 구축(2공동)