김건우 교수 연구실
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바이러스 RNA 상주·변형을 분석하는 실험 플랫폼 및 3차원 감염 모델 연구

Experimental Platforms for Viral RNA Residence and m6A Mapping Using 3D Infection Models

연구 내용

m6A 변형을 정밀하게 포착하는 MeRIP 기반 분석과, HBV 감염을 재현하는 3차원 간 오가노이드 플랫폼을 통해 바이러스 RNA 상주 조절 기전을 해석하는 연구

바이러스 RNA의 기능을 해석하기 위해 m6A 변형 포착과 감염 모델을 동시에 활용합니다. MeRIP(Methylated RNA Immunoprecipitation) 기반 접근으로 HBV RNA의 m6A 존재와 분포를 분석하고, 변형이 바이러스 생애 과정과 연동되는 연구에 필요한 측정 체계를 확보합니다. 또한 3차원 간 오가노이드를 감염 모델로 적용하여 숙주-바이러스 상호작용과 만성 감염 관련 병리 변화를 재현하고, 기존 세포주 중심 모델의 한계를 보완합니다. 아울러 카포시 육종 헤르페스 바이러스의 PAN RNA가 핵 내에 상주하는 조절 메커니즘을 함께 탐구하여 바이러스 RNA의 국소화와 조절 요인을 연결해 해석합니다.

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연구 흐름

초기에는 HBV RNA의 m6A를 규명하기 위한 분석 방법으로 MeRIP 기반 측정 절차를 정립하고, 결과를 해석하는 실험 워크플로를 구축했습니다. 이후에는 감염의 생리적 관련성을 높이기 위해 3차원 간 오가노이드 기반으로 HBV 감염과 HBV 관련 간질환의 연구 가능성을 확장했습니다. 병행하여 다른 헤르페스바이러스의 비암호화 RNA인 PAN RNA를 대상으로 발현과 핵 내 상주 조절 기전을 파악하는 연구를 수행하며, RNA 위치 기반 조절 개념을 감염 연구에 통합하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • MeRIP 기반 m6A 분석 프로토콜
  • HBV 감염 3차원 오가노이드 모델
  • 바이러스 RNA 국소화 정량 분석
  • 바이러스-숙주 상호작용 평가 체계
  • RNA 변형 기반 약효 평가 플랫폼
  • 만성 감염 병리 재현형 실험 모델
  • 비암호화 RNA 핵 상주 조절 타깃
  • RNA-결합 인자 스크리닝 실험
  • 감염 모델 기반 항바이러스 후보 탐색
  • 바이러스 지속성 차단 전략 도출

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