인간의 게놈은 약 100개의 탈유비퀴틴화효소(DUBs)를 암호화하지만, 그중 프로테아좀과 연관된 DUB(pDUB)로 간주되는 것은 세 가지—PSMD14/Rpn11, USP14, UCHL5—뿐이다. 이들 가운데 PSMD14만이 19S의 불가결한(subunit) 구성요소인 반면, USP14와 UCHL5는 특정 프로테아좀 소단위에 일시적으로 결합한다. 프로테아좀 조성의 동적 특성을 고려하여, 우리는 추가적인 pDUB를 탐색하였다. 배양 세포에서 정제한 26S 프로테아좀과 연관된 단백질로 USP15가 확인되었다. 적혈구로부터 얻은 프로테아좀 제제에서는 USP15가 가장 풍부한 일시적 pDUB로 동정되었다. 또한 USP15를 포함하는 프로테아좀과 USP14를 포함하는 프로테아좀을 분리하는 것조차 가능하였다. USP15는 프로테아좀에 자신을 위치시키기 위해 내부의 유비퀴틴-유사(UBL) 도메인을 사용하지만, UBL을 포함하는 USP14와 경쟁하지는 않았다. USP15는 짧은 폴리유비퀴틴(polyUb) 사슬을 효율적으로 분해하여 프로테아좀에서의 기질 선택을 촉진하는 한편, K48 결합의 테트라-유비퀴틴 접합체는 탈유비퀴틴화에서 보존하였다. 이러한 특징은 단백질 분해로의 처리가 이미 결정된 기질과, 회수되어야 할 기질을 구분하는 데 프로테아좀이 도움을 받을 수 있음을 시사한다. 네 번째 pDUB의 동정은, 기질 특이성을 상황(문맥) 특이적으로 조절하는 추가적인 프로테아좀-상호작용 단백질을 계속해서 탐색하도록 독려한다.

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