식물 세포유전/세포유전체 지도를 위한 FISH 기반 Cytogenomics

FISH-based Cytogenomics for Plant Cytogenetic and Genome Organization Mapping

연구 내용

식물 종 간 염색체 수·구조 변이를 형광 in situ hybridization과 PLOP-FISH로 지도화하고, flow cytometry로 유전체 크기를 함께 추정하여 유전체 조직과 종분화 관련성을 해석하는 연구

식물 세포유전 분석에서 종별 염색체 조성을 비교하기 위해 FISH와 PLOP-FISH를 기반으로 반복서열 신호를 염색체 위치에 매핑합니다. 필요 시 세포주기 동기화를 통해 분열중기 표본을 확보하고, flow cytometry로 유전체 크기와 DNA 함량을 추정하여 현상 데이터를 염색체 수준 정보와 결합합니다. 센나, 솔라눔, 히비스커스 등에서 다색 FISH를 적용해 염색체 재배열과 배수성 변화에 따른 반복서열 분포 차이를 정량적으로 비교함으로써 유전체 조직의 변화를 해석하는 차별성을 갖습니다.

관련 프로젝트

0건

연구 흐름

초기에는 Panax ginseng 뿌리에서 세포주기 동기화를 활용해 세포유전 분석이 가능한 분열중기 표본을 확보하고, 이를 바탕으로 반복서열 기반 FISH 신호를 염색체 수준에서 관찰하는 연구를 수행했습니다. 이후에는 tandem repeat을 PLOP-FISH로 전개하여 세나 속의 유전체 진화 및 종분화 과정의 염색체 재배열 양상을 비교하는 방향으로 확장되었습니다. 최근에는 triple-color FISH 및 다색 PLOP-FISH를 통해 Solanum과 Hibiscus의 염색체 구성과 유전체 크기 변이를 종·계통·배합 조합별로 확인하며, 배수성 및 유전체 구조 다양성을 축적하는 연구를 수행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

다색 FISH 프로브 패널 설계
배수성 판별 기준 데이터 구축
종 간 염색체 재배열 패턴 비교
유전체 크기 추정 기반 선발 도구
cytogenetic marker 검증 프로토콜
재배·육종 계통의 계통표지
반복서열-염색체 구조 상관분석
종분화 기작 추정 체계
종자·유전자원 품질관리 지표
비교 게놈 분석용 매핑 데이터