단백질에 결합된 망막(retinal)은 단백질 환경에 따라 흡수 파장이 상당히 달라지는 크로모포어(chromophore)이다. 이는 동물의 시각에 핵심적인 구성요소이며, 특정 미생물에서 빛을 대사 에너지로 전환하는 데 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 시간 의존적 밀도범함수이론(time‐dependent density functional theory)을 사용하여 여러 조건에서 양성자화된 쉬프 염기(protonated Schiff base) 형태의 all‐trans‐retinal의 흡수 파장을 계산하고, 전기정적 상호작용이 색조 조절(color‐tuning)에 중요함을 보였다. 또한 구조적 변화 역시 흡수 파장에 어느 정도 영향을 미친다.

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