이명원 교수 연구실
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TDDFT로 레티날 흡수 파장 튜닝 메커니즘 규명 연구

Tuning of Absorption Wavelength of Retinal Studied by Time-Dependent Density Functional Theory

연구 내용

레티날이 단백질 환경에서 겪는 변화가 흡수 파장에 미치는 영향을 시간의존 밀도범함수이론(TDDFT)으로 계산해, 전기정 상호작용과 구조 변화의 기여를 구분하는 연구

레티날은 단백질 환경에 따라 흡수 파장이 크게 변하는 크로모포어이며, 이를 계통적으로 설명하기 위해 TDDFT 계산을 수행합니다. 전하 상태를 반영한 프로톤화 쉬프 염기 형태의 all-trans 레티날을 다양한 조건에서 모델링하고 흡수 파장을 산출합니다. 그 결과 전기정 상호작용이 색조 조절에 주요하게 작용함을 확인하며, 구조 변화 역시 흡수 파장에 영향을 주는 정도를 함께 해석합니다. 이를 통해 생체 광수용체의 분광 특성 원인을 계산 수준에서 정리합니다.

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연구 흐름

초기 연구에서는 레티날의 대표 모델인 프로톤화 쉬프 염기 형태를 기반으로 TDDFT 계산 체계를 구성합니다. 이후 단백질 환경을 모사하는 조건들을 변화시켜 흡수 파장의 변화를 관찰하고, 전기정적 효과와 구조적 효과를 분리해 해석합니다. 다음 단계에서는 계산 결과를 광화학·바이오피직스 관점에서 연결하여 색조 튜닝의 핵심 요인을 정리합니다. 최근에는 분광 특성 예측을 목표로 조건-응답 관계를 확장하는 방향으로 연구를 수행합니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • 광수용체 분광 특성 예측
  • 단백질-크로모포어 상호작용 해석
  • 색조절형 크로모포어 탐색
  • 광학 신호 분광 모델링
  • 광전 소재 설계 가이드
  • 광화학 반응 조건 추정
  • 생체광학 기반 진단 프로브 설계
  • 스펙트럼 튜닝 설계
  • 분자 수준 조절 지표 도출
  • 광학 센싱 물성 예측

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Tuning of Absorption Wavelength of Retinal Studied by <scp>Time‐Dependent</scp> Density Functional Theory

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