CD4+ T세포에서 DNA methylation-연관 전사체 변화를 매개하는 RA 유전효과 규명

Mediation of RA genetic effects via differential DNA methylation shaping transcriptomic features in CD4+ T cells

연구 내용

RA 환자 CD4+ T세포의 차등 발현과 차등 메틸화를 통합하고 QTL 및 partitioned-heritability enrichment으로 변이-후성조절 연결을 설명하는 연구

RA 환자와 대조군의 CD4+ T세포에서 차등 발현 유전자와 차등 메틸화 영역을 동시에 도출하고, 위험 변이의 조절 기능을 정량유전자좌(QTL) 관점에서 해석합니다. 차등 메틸화 영역이 T세포 조절 부위에 편중되어 분화·활성 관련 유전자 발현과 상관을 보이는지 확인하고, 전사체 변화가 위상적 염색질 도메인 수준에서 연결되는 패턴을 평가합니다. 이어서 eQTL과 meQTL을 연결해 유전 변이가 후성조절을 통해 표현형과 유전가능성을 매개하는 기전을 제시합니다. 본 연구는 세포 특이적 조절 인자 탐색을 위한 이질성 조직 기반 접근과도 연계됩니다.

관련 프로젝트

1건

연구 흐름

2020년 수준의 위험 좌위 확장과 변이 우선화 흐름을 기반으로, 2021년에는 CD4+ T세포에서 다차원 오믹스를 직접 측정하여 RA 특이 DEGs와 DMRs를 구분했습니다. 이후 QTL(발현 QTL 및 meQTL)과의 연계를 통해 DEG-상관 DMR이 RA 유전가능성을 유의하게 설명하는 방향성을 검증했습니다. 2021~2023년 수행 과제에서는 이질성 조직에서 세포 특이 조절 인자를 탐색하는 프레임을 강화하여, 후성유전체 매개 기전의 후속 검증 전략을 구체화하는 연구 흐름을 형성했습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

CD4+ T세포 기능조절 인자 발굴
후성유전체 기반 RA 위험 설명
메틸화-유전자 조절 네트워크 구축
표적 경로 기반 치료 전략
개인별 유전-후성 바이오마커
QTL 연계 약물 반응 예측
질환 관련 염증 프로그램 모델링
단일 세포 수준 검증 실험 설계
치료 표적의 우선순위 스코어링
유전효과의 가역성 평가