Acanthamoeba는 기회감염 병원체로서 Acanthamoeba 각막염, 육아종성 아메바성 뇌염 및 기타 피부 질환을 유발한다. Acanthamoeba의 생활사는 영양형(trophozoite)과 낭종(cyst)의 2단계로 이루어진다. 불리한 환경 조건에서는 Acanthamoeba가 낭종화(encystation)하며, 성장에 유리한 조건이 조성되면 영양형으로 다시 전환된다. Acanthamoeba의 탈낭종화(excystation)는 증식에 핵심적이며, 불완전한 치료 후 재발성 감염으로 이어질 수 있다. 탈낭종화에 관여하는 요인을 규명하기 위해 A. castellanii를 낭종화 유도 조건 또는 탈낭종화 유도 조건에 각각 노출시키고, mRNA sequencing을 이용하여 유전자 발현 프로파일을 비교하였다. A. castellanii 시료는 두 조건 모두에서 분석을 위해 8시간 간격으로 채취하였다. 차등 발현 유전자 분석 결과, 초기 탈낭종화 동안 2배 이상 증가한 유전자는 1,214개, 감소한 유전자는 1,163개로 나타났다. 초기 탈낭종화에서 현저하게 상향 조절된 5개 유전자(ACA1_031140, ACA1_032330, ACA1_374400, ACA1_275740, ACA1_112650)를 선정하고, 이들의 발현 수준을 실시간 PCR을 통해 확인하였다. 이들 5개 유전자를 표적하는 small interfering RNA(siRNA)를 Acanthamoeba에 형질주입하고, 실시간 PCR로 유전자 억제를 검증하였다. ACA1_031140, ACA1_032330, ACA1_374400, ACA1_112650의 침묵은 탈낭종화를 억제하였으며, 해당 유전자들이 탈낭종화에 필수적일 수 있음을 시사하였다. 본 연구의 결과는 Acanthamoeba의 증식과 재발을 억제하기 위한 유용한 통찰을 제공한다.

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