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인용수 17
·2023
RNA sequencing-based transcriptome analysis of granulosa cells from follicular fluid: Genes involved in embryo quality during in vitro fertilization and embryo transfer
Eun Jeong Yu, Won Yun Choi, Mi Seon Park, Jin Hee Eum, Dong Ryul Lee, Woo Sik Lee, Sang Woo Lyu, Sook Young Yoon
IF 2.9 (2023) PLoS ONE
초록

배경: 과립막 세포는 난포형성에서 중요한 역할을 하나, 과립막 세포의 RNA 전사체가 배아의 질을 평가하는 데 있어 어떠한 역할을 하는지는 아직 불명확하다. 따라서 본 연구의 목적은 과립막 세포의 RNA 전사체를 사용하여 배아의 발생 발달 능력의 가능성을 평가할 수 있는지를 조사하는 것이다. 방법: 본 전향적 코호트 연구에서는 과립막 세포의 RNA 시퀀싱을 통해 배아 발생 발달 능력의 가능성을 산출하고자 하였다. 과립막 세포는 체외수정 및 배아이식 치료를 받는 여성에서 양질의 배아군 48개 샘플과 저질의 배아군 79개 샘플에서 수집하였다. 각 군에서 3개 샘플을 RNA 시퀀싱에 사용하였다. 결과: 배아의 높은 발달 적격성과 관련된 226개의 차등 발현 유전자(DEGs)가 확인되었다. 유전자 온톨로지( Gene Ontology ) 농축 분석 결과, 이들 DEGs는 주로 생물학적 과정, 분자 기능 및 세포 성분에 관여하는 것으로 나타났다. 또한 경로 분석에서는 이들 DEGs가 13개의 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 경로에 풍부하게 포함되는 것으로 확인되었다. 역전사 정량 중합효소연쇄반응(RT-qPCR)으로 13개 선택 유전자의 차등 발현을 검증하였다. 그중 10개 유전자는 양질의 배아군에 비해 저질의 배아군에서 다르게 발현되었으며, 여기에는 CSF1R, CTSH, SERPINA1, CYP27A1, ITGB2, IL1β, TNF, TAB1, BCL2A1 및 CCL4가 포함되었다. 결론: RNA 시퀀싱 데이터는 배아의 발생 발달 능력을 식별하기 위한 비침습적 바이오마커로서 과립막 발현 유전자의 유용성을 지지하거나 반박하는 근거를 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
BiologyEmbryoTranscriptomeEmbryo qualityGeneKEGGGeneticsGene expressionEmbryogenesisAndrology
타입
Article
IF / 인용수
2.9 / 17
게재 연도
2023