오한빈 교수 연구실
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연구 분야
프로젝트
논문
구성원
article|
인용수 12
·2022
New free radical-initiated peptide sequencing (FRIPS) mass spectrometry reagent with high conjugation efficiency enabling single-step peptide sequencing
Sang Tak Lee, Hyemi Park, Inae Jang, Choong Sik Lee, Bongjin Moon, Han Bin Oh
IF 4.6 (2022) Scientific Reports
초록

양이온 모드(positive ion mode)에서 실험을 모니터링하였다. 단일 단계 열 활성화 조건에서 p-TEMPO-Bn-Sc-peptide에서도 단편 이온이 관찰되었으며, 주로 a-/x- 및 c-/z-형 단편과 중성 손실(neutral loss) 이온이 나타났다. 이는 p-TEMPO-Bn-Sc-peptide에서 라디칼에 의해 매개되는 펩타이드 골격 분해가 일어났음을 확인한다. 이전 TEMPO 시약, 즉 o-TEMPO-Bz-C(O)-NHS와 비교할 때, 새로 설계된 p-TEMPO-Bn-Sc-NHS는 구조적 유연성과 실험 시약에서의 용해도가 향상되어 표적 펩타이드에 대한 접합 효율이 더 우수하다. 적용된 정규화 충돌 에너지(normalized collision energy, NCE)에 따른 생존 분율(survival fraction)을 이용한 에너지 해석은 p-TEMPO-Bn-Sc- 및 o-TEMPO-Bz-C(O)- 라디칼 개시제 사이의 열 활성화 차이를 규명하였다. 본 연구는 p-TEMPO-Bn-Sc- 라디칼 개시제를 적용하면 듀티 사이클(duty cycle)을 향상시킬 수 있음을 명확히 보여주며, 이러한 FRIPS MS 접근법은 인산단백질체(proteomics) 연구, 특히 인산단백질체(phosphoproteomics) 연구에 적용될 수 있는 잠재력을 지닌다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
ChemistryReagentPeptideCombinatorial chemistryMass spectrometryChromatographyBiochemistryOrganic chemistry
타입
article
IF / 인용수
4.6 / 12
게재 연도
2022

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