세포외 소포(extracellular vesicles, EVs)는 지질 이중층으로 둘러싸인 나노 크기의 소포로, 대부분의 세포에서 세포외 환경으로 방출된다. 다양한 EV 분리 방법이 확립되어 있음에도 불구하고, 현재의 대부분의 방법은 오염된 비(非)소포성 단백질을 함께 포함한 EV를 분리한다. 사람 결장암 세포 SW480에서 유래한 EV에 대해 무표지 정량 단백질체 분석(label-free quantitative proteomic analyses)을 적용함으로써, 우리는 트립신에 민감한(trypsin-sensitive) 소포성 단백질과 트립신에 저항성인(trypsin-resistant) 소포성 단백질을 확인하였다. 이어서 세포 내 위치에 기반한 추가적인 시스템 생물학 및 단백질-단백질 상호작용 네트워크 분석을 통해, 트립신에 민감한 및 트립신에 저항성인 소포성 단백질을 두 하위 집단으로 분류하였다. 즉 363개의 후보 진성 소포성 단백질(candidate real-vesicular proteins)과 151개의 오염된 비소포성 단백질(contaminated non-vesicular proteins)이다. 또한 단백질 상호작용 네트워크 분석 결과, 후보 진성 소포성 단백질은 주로 세포막(plasma membrane, 46.8%), 세포질(cytosol, 36.6%), 세포골격(cytoskeleton, 8.0%), 세포외 영역(extracellular region, 2.5%)에서 유래한 것으로 나타났다. 반면 오염된 비소포성 단백질의 대부분은 핵(nucleus), 골지체(Golgi apparatus), 소포체(endoplasmic reticulum) 및 미토콘드리아(mitochondria)에서 유래하였다. 더불어 리보솜 단백질 복합체(ribosomal protein complexes)와 T-복합체 단백질(T-complex proteins)은 오염된 비소포성 단백질로 분류되었다. 종합하면, EV에 대한 우리의 트립신 처리(proteomic) 기반 접근법은 EV 방출 시 EV 생합성 및 단백질 화물 선택(protein cargo-sorting) 기작을 이해하는 데 도움이 될 수 있는 진성 소포성 단백질을 규명하고, 보다 신뢰할 수 있는 EV 진단 바이오마커 단백질을 발굴하며, EV의 병태생리학적 역할을 해독하는 데 중요한 진전을 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.