미생물군집(microbiome) 연구는 기술 발전과 분석 방법론의 상당한 비용 절감에 힘입어 최근 수년간 진전되어 왔다. 곤충에서의 미생물군집에 대한 연구는 다른 동물 종에 비해 제한적이다. 본 연구는 한국의 서로 다른 사육 농장에서 깔다리벌레(mealworms) (Tenebrio molitor)의 세균 조성을 비교하기 위해 수행되었다. 이를 위해 한국의 세 농장에서 깔다리벌레 유충 시료를 수집하고, 유전체 DNA를 추출하였다. 추출한 DNA는 세균 군집을 동정하기 위해 16S rRNA의 V3–V4 영역에서 유래한 프라이머를 사용하여 염기서열을 분석하였다. 원자료는 QIIME2 파이프라인을 이용하여 다양성, 분류학적 특성, 집단 간 차등 풍부도(differential abundance)를 확인하였다. 본 연구에서는 6개 문(phylum)에 속하는 23개 개체에서 곤충 관련 세균 가족을 포괄적으로 특성화하였으며, 16S rRNA 유전자의 32,827개 증폭산(amplicon)을 시퀀싱하였다. 또한 서로 다른 세 농장에서 사육된 T. molitor의 생(活) 및 사(死) 유충으로부터 총 637,204개의 서열 읽기(sequence reads)를 확보하였다. 품질 관리, 노이즈 제거(denoising), 병합(merging), 키메라 제거(chimera removal)를 거친 후 총 637,204개의 읽기가 얻어졌으며, 이는 세 농장의 T. molitor 생·사 유충에서 32,827개의 세균 증폭산 서열 변이(amplicon sequence variants)를 확인하는 결과였다. 곤충 미생물군집은 Firmicutes(52.6%)와 Proteobacteria(46.3%)가 지배하였다.

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