김상욱 교수 연구실
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Article|
인용수 18
·2022
Evolutionary rewiring of regulatory networks contributes to phenotypic differences between human and mouse orthologous genes
Doyeon Ha, Donghyo Kim, Inhae Kim, Youngchul Oh, JungHo Kong, Seong Kyu Han, Sanguk Kim
IF 14.9 (2022) Nucleic Acids Research
초록

마우스 모델은 특정 가정에 기반하여 인간 질환의 생물학적 기전을 밝히기 위해 설계되어 왔다. 그 가정은 종에 걸쳐 보존된 표현형을 유발하는 기반이 상동(orthoologous) 유전자에 있다는 것이다. 그러나 인간 유전자의 유전적 변형 마우스 상동체는 종종 인간 질환의 표현형을 재현하지 못하는데, 이는 마지막 공통 조상으로부터의 시간 동안 종 간 표현형 차이의 분자적 진화가 원인일 수 있다. 여기서는 기능 모듈에서 전사인자(TF)와 표적 유전자 간 조절 관계의 진화적 분화를 체계적으로 조사하였고, 유전자 조절 네트워크(GRN)의 재배선(rewiring)이 인간과 마우스 사이에서 발생하는 표현형 불일치에 기여함을 확인하였다. 또한 상동 유전자의 재배선된 조절 네트워크가 종 특이적 조절 요소의 비율이 더 높음을 확인하였다. 더 나아가 네트워크 재배선에 의해 유발된 표적 유전자 발현 수준의 분화가 표현형 차이를 초래할 수 있음을 검증하였다. 종합하면, 조절 네트워크에서의 진화적 분화를 신중히 고려하는 것은 마우스 모델이 인간 질환을 모사하는 데 실패하거나 성공하는지를 이해하기 위한 새로운 전략이 될 수 있다. 인간 질환 연구에서 마우스 표현형을 해석하는 데 도움을 주기 위해, 우리는 웹사이트(http://sbi.postech.ac.kr/w/RN)에서 유전자 발현 프로파일에 대한 정량적 비교 자료를 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
BiologyPhenotypeGeneGeneticsGene regulatory networkRegulation of gene expressionRegulatory sequenceComputational biologyTranscription factorEvolutionary biology
타입
Article
IF / 인용수
14.9 / 18
게재 연도
2022

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