김상욱 교수 연구실
기본 정보
연구 분야
프로젝트
논문
구성원
Article|
인용수 3
·2025
Semi-automated biofoundry workflows for sequence coevolution-guided isoprene synthase engineering
Georgii Emelianov, Dong-Uk Song, Aporva Kamath, Hyeongseop Kim, Geunyeong Lee, Ha‐Neul Kim, Kil Koang Kwon, Bong Hyun Sung, Dae‐Hee Lee, Nathan J. Hillson, Haseong Kim, Sanguk Kim, Hyewon Lee, Seung‐Goo Lee
IF 14.9 (2025) Trends in biotechnology
초록

바이오파운드리는 효소 및 미생물 공학을 생물제조(biomanufacturing) 방향으로 가속하기 위한 전환적 플랫폼으로 작용한다. 본 연구에서는 바이오파운드리 응용에 맞춘 확장 가능한 효소 공학 워크플로를 개발하였으며, 이소프렌 합성효소(IspS)는 이소프렌 생합성에서 핵심적 속도-제한 효소라는 점에 초점을 두었다. 서열 공진화 분석에 기반한 계산적 돌연변이 설계와 실험실 자동화를 통합하여, 부위지정 돌연변이 유도 및 스크리닝을 3회 수행하였다. 각 라운드마다 약 100개의 유전적 돌연변이체를 합성하였고, 이러한 워크플로는 광범위한 최적화 없이도 수천 단위로 손쉽게 확장될 수 있다. 또한 이 접근법을 통해 촉매 효율이 최대 4.5배 향상된 IspS 변이체를 신속히 동정할 수 있었으며, 동시에 열안정성도 향상되었다. 더 나아가 공학적으로 설계된 IspS를 Methylococcus capsulatus Bath에 도입함으로써 메탄-대-이소프렌(methane-to-isoprene) 생물전환이 개선되어 319.6 mg/L의 생산성(titer)을 달성하였다. 이러한 확장 가능한 워크플로는 바이오파운드리 내 효소 공학을 위한 견고한 기반을 제공한다. 이는 혁신적인 생명공학적 발전의 개발을 위한 토대가 된다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
WorkflowProtein engineeringScalabilityMutagenesisDeoxyribozymeSequence (biology)EnzymeMetabolic engineeringDirected evolution
타입
Article
IF / 인용수
14.9 / 3
게재 연도
2025

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