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송지준 연구실
한국과학기술원 생명과학과
송지준 교수
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송지준 연구실

한국과학기술원 생명과학과 송지준 교수

본 연구실은 구조생물학과 구조분자생물학을 기반으로 크로마틴 조절 복합체, 뉴클레오좀 다이나믹스, 질환 연관 단백질의 작동기작을 규명하는 한편, 초저온전자현미경과 분자설계를 활용해 자기조립 단백질 나노구조체, 표적 단백질 전달체, 백신 플랫폼 및 구조기반 신약개발 기술을 연구하는 생명과학 연구실이다.

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구조생물학 기반 크로마틴 및 단백질 복합체 작동기작 연구 thumbnail
구조생물학 기반 크로마틴 및 단백질 복합체 작동기작 연구
주요 논문
5
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1
article
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hybrid
·
인용수 0
·
2026
Deposition of CENP-ACse4 is enhanced by mutations in the AAA+ ATPase domain of ATAD2Yta7
Navpreet Kaur, Carol M. Cho, Anke Samel-Pommerencke, Sara Shahnejat‐Bushehri, Alexandra Poßling, Jolita Kuznecova, Ji‐Joon Song, Ann E. Ehrenhofer‐Murray
IF 5.1
Genetics
The chromatin remodelling factor and histone chaperone Yta7 is a member of the ATAD2 family of AAA+ ATPases from Saccharomyces cerevisiae that has in vivo functions consistent with both nucleosome assembly and disassembly activity. At the centromere, Yta7 is required for proper deposition of the centromeric histone H3 variant CENP-A Cse4. Here, we performed a genetic screen to identify suppressors of the defect of a mutation in CENP-A Cse4 that impairs the interaction with the DNA of the centromeric nucleosome (cse4-S135A). This identified two suppressor alleles of YTA7, yta7-R483S and -D518E, which are in the AAA1 domain of Yta7. Interestingly, Yta7-R483S enhanced the deposition of CENP-A Cse4 at the centromere and showed a ∼40% increased ATPase activity, suggesting that the hyperactivity of the motor domain is responsible for suppression of the cse4-S135A growth defect. In contrast, Yta7-D518E showed reduced ATPase activity, but both Yta7-R483S and -D518E retained the interaction with CENP-A Cse4 and centromeric sequences as well as hexamer formation in vitro. Our analysis of in vivo interactions between Yta7 and CENP-A Cse4 further showed that the two AAA+ domains and the non-canonical bromodomain of Yta7 are necessary and sufficient for interaction with CENP-A Cse4. The genetic screen furthermore revealed a mutation in the chromatin remodeler Fun30 as a suppressor of the centromeric defect of cse4-S135A. Altogether, this work reveals unusual, hypermorphic properties of Yta7 variants and highlights the importance of nucleosome remodelers in establishing centromeric chromatin.
https://doi.org/10.1093/genetics/iyag035
Chromatin
Nucleosome
Saccharomyces cerevisiae
Random hexamer
Histone
Centromere
Mutation
ATPase
DNA
2
article
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bronze
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인용수 0
·
2023
Construction and Functionalization of a Clathrin Assembly for a Targeted Protein Delivery (Small 8/2023)
Hong‐Sik Kim, Jinho Bae, Gijeong Kim, Ji‐Joon Song, Hak‐Sung Kim
IF 12.1
Small
Targeted Protein Deliveries In article number 2204620, Hak-Sung Kim and co-workers develop a new type of protein self-assembly using human clathrin for a targeted protein delivery. A redesigned clathrin triskelion is dual-functionalized with functional biomolecules. The resulting clathrin assembly exhibits a significantly high avidity and an efficient delivery of a protein cargo into tumor cells.
http://dx.doi.org/10.1002/smll.202370050
Clathrin
Avidity
Nanotechnology
Chemistry
Endocytosis
Materials science
Biochemistry
Medicine
Antibody
Receptor
3
article
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hybrid
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인용수 13
·
2023
A pH‐Responsive Virus‐Like Particle as a Protein Cage for a Targeted Delivery
Kwan‐Jip Kim, Gijeong Kim, Jinho Bae, Ji‐Joon Song, Hak‐Sung Kim
IF 9.6
Advanced Healthcare Materials
A stimuli-responsive protein self-assembly offers promising utility as a protein nanocage for biotechnological and medical applications. Herein, the development of a virus-like particle (VLP) that undergoes a transition between assembly and disassembly under a neutral and acidic pH, respectively, for a targeted delivery is reported. The structure of the bacteriophage P22 coat protein is used for the computational design of coat subunits that self-assemble into a pH-responsive VLP. Subunit designs are generated through iterative computational cycles of histidine substitutions and evaluation of the interaction energies among the subunits under an acidic and neutral pH. The top subunit designs are tested and one that is assembled into a VLP showing the highest pH-dependent structural transition is selected. The cryo-EM structure of the VLP is determined, and the structural basis of a pH-triggered disassembly is delineated. The utility of the designed VLP is exemplified through the targeted delivery of a cytotoxic protein cargo into tumor cells in a pH-dependent manner. These results provide strategies for the development of self-assembling protein architectures with new functionality for diverse applications.
https://doi.org/10.1002/adhm.202302656
Nanocages
Protein subunit
Coat protein
Histidine
Virus-like particle
Nanotechnology
Biophysics
Protein design
Chemistry
Bacteriophage
정부 과제
67
과제 전체보기
1
2024년 8월-2025년 8월
|60,000,000
식물 수용체인산화효소 복합체 활성화 메커니즘에 대한 구조 및 생화학적 규명
본 연구는 식물 패턴인지수용체가 어떻게 외부 자극을 세포 내 신호로 변환하고 전달하는지에 대한 메커니즘을 이해하고자 한다. 첫번째로 식물의 패턴인지수용체가 세포내에서 어떻게 복합체를 형성하고 있는지에 대해서 이해한다. 본 연수자는 Cyril Zipfel 교수 연구실에서 박사후 연수를 통해 패턴인지수용체가 세포내에서 복합체를 형성하고 있는 것을 확인하였다. ...
수용체인산화효소
패턴인지수용체
초저온전자현미경
2
2024년 8월-2025년 8월
|60,000,000
항체 레퍼토리 내에서 바이러스 변이들에 대항하는 항체의 성숙과정 규명
- 항체 레퍼토리의 다양한 바이러스 변이들에 대한 특이성 성숙과정 규명 항체 레퍼토리 내의 항체들의 바이러스 변이들에 대한 특이성 성숙과정을 규명하는 것을 최종 목표로 합니다. 다양한 바이러스 변이들에 대해 서로 다른 범위의 특이성을 가지는 항체 클론들이 레퍼토리 내에서 어떻게 조직화하고 성숙해 가는지 규명합니다. 이 과정을 통해 체내의 면역계가 노출된,...
항체
레파토리
바이러스
특이성
3
2024년 6월-2026년 12월
|5,000,000,000
첨단 바이오 대형연구장비 공동활용 체계구축
첨단 대형 연구 장비의 효율적인 공유와 활용을 위한 디지털바이오 R&D 기반을 구축하고, 이를 위한 현장 실무형 전문인력을 양성하는 것을 목표로 함. 이 과제는 1.2 GHz NMR, Cryo-EM 장비를 포함하고, 다수의 디지털 바이오 연계장비와 같은 첨단 바이오 대형연구장비 공동활용 체계를 구축하고자 함. 이를 위해 다음과 같은 세부목표를 설정함. 1....
대형 연구장비
공동활용
핵자기공명
전자현미경
분석데이터
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
등록2021BP26 및 항원 폴리펩타이드를 포함하는 융합 단백질1020210144034
등록2020ASH1L 히스톤 메틸화 효소 활성을 억제하는 벤조퓨란-피라졸 유도체 화합물을 포함하는 백혈병의 예방 또는 치료용 조성물1020200020949
등록2020ASH1L 히스톤 메틸화 효소 활성을 억제하는 벤조디옥솔 유도체 화합물을 포함하는 백혈병의 예방 또는 치료용 조성물1020200020947
전체 특허

BP26 및 항원 폴리펩타이드를 포함하는 융합 단백질

상태
등록
출원연도
2021
출원번호
1020210144034

ASH1L 히스톤 메틸화 효소 활성을 억제하는 벤조퓨란-피라졸 유도체 화합물을 포함하는 백혈병의 예방 또는 치료용 조성물

상태
등록
출원연도
2020
출원번호
1020200020949

ASH1L 히스톤 메틸화 효소 활성을 억제하는 벤조디옥솔 유도체 화합물을 포함하는 백혈병의 예방 또는 치료용 조성물

상태
등록
출원연도
2020
출원번호
1020200020947