최근 염기서열 분석 및 유전체 조립 기술의 발전은 다양한 종과 품종에서 고품질 유전체 조립체를 빠르게 생성하는 데 기여해 왔다. 생의학 연구에서 동물 모델로서 미니피그(minipig)의 중요성에도 불구하고, 미니피그의 고품질 유전체 조립체 구축은 다른 돼지 품종에 비해 여전히 뒤처져 있다. 이 문제를 해결하기 위해 우리는 서로 다른 여러 유형의 시퀀싱 읽기와 기준(reference) 유전체를 활용하여 한국 미니피그(Korean minipig, KMP)의 고품질 염색체 수준 유전체 조립체를 구축하였다. KMP 조립체는 총 길이 2.52 Gb와 N50 137 Mb를 갖는 19개의 염색체 수준 서열을 포함하였다. 돼지 기준 유전체(Sscrofa11.1)와의 비교 분석 결과, KMP 조립체는 유사한 연속성과 완전성을 보였다. 또한 유전체 주석 분석을 통해 22,666개의 단백질 코딩 유전자를 확인하였고, 반복 서열(repetitive elements)은 유전체의 40.10%를 차지하는 것으로 나타났다. KMP 조립체 및 유전체 주석은 미니피그와 다른 돼지 품종에 대한 향후 다양한 연구에 기여할 수 있는 유용한 자원을 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.