미니피그는 작은 체구를 포함한 뚜렷한 장점 때문에 생의학 연구에서 동물 모델로 널리 사용되고 있다. 그러나 이러한 특징을 형성하는 데 있어 장 비암호화 RNA(long non-coding RNAs; lncRNAs)의 조절 역할은 아직 규명되지 않았다. 본 연구에서는 미니피그 3품종(ET-type, L-type 및 Bama 미니피그)과 돼지 2품종(Duroc 및 Landrace)에서 심장, 신장, 간, 폐, 비장 등 5개 조직을 대상으로 비교 전사체 분석을 수행하였다. 그 결과 5,288개의 lncRNA를 확인하였으며, 이들의 발현 양상이 단백질 코딩 유전자보다 품종을 보다 뚜렷하게 구분함을 관찰하여, lncRNA와 이들 사이에는 서로 다른 진화적 제약이 존재할 가능성을 시사하였다. 차등 발현 분석을 바탕으로, 미니피그와 돼지 간에서 일관된 발현 차이를 보이는 조직 공통 lncRNA(tissue-common lncRNAs; tcDELs)와, 개별 미니피그 조직에서 고유한 발현 양상을 나타내는 조직 특이적 lncRNA(tissue-specific lncRNAs; tsDELs)를 확인하였다. 발현 상관 분석과 연관 단백질 코딩 유전자의 기능 농축을 통해, 이러한 lncRNA가 다양한 생물학적 과정에 관여함을 확인하였다. 특히 tcDELs는 전 조직에 걸친 장기 크기 및 유전자 조절과 관련된 경로와 연관되었으며, tsDELs는 각 조직에 특이적인 생리 기능과 연관되었다. 본 연구 결과는 lncRNA가 미니피그에서 조직 공통 특성과 조직 특이적 특성 모두에 기여할 수 있음을 보여주며, 동물 모델로서의 유용성을 한층 강화한다.

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