김재범 교수 연구실
기본 정보
연구 분야
논문
구성원
article|
인용수 8
·2023
A chromosome-level genome assembly of the Korean crossbred pig Nanchukmacdon (Sus scrofa)
Daehong Kwon, Nayoung Park, Suyeon Wy, Daehwan Lee, Han‐Ha Chai, In‐Cheol Cho, Jongin Lee, Kisang Kwon, Heesun Kim, Youngbeen Moon, Juyeon Kim, Woncheoul Park, Jaebum Kim
IF 5.8 (2023) Scientific Data
초록

양질의 방대한 게놈 조립체가 축적됨에 따라, 기준(reference) 유도 게놈 조립은 고품질 조립체를 재구성하는 데 유용한 접근법이 될 수 있다. 본 연구에서는 단기 및 장기 판독값을 사용한 기준 유도 조립 접근법으로 한국 재래 교잡종 돼지인 Nanchukmacdon(이하 NCMD)의 염색체 수준 게놈 조립체를 제시한다(이하 NCMD 조립체). NCMD 조립체는 총 크기 2.38 Gbp의 20개의 염색체 수준 스캐폴드를 포함하며(N50: 138.77 Mbp), BUSCO 점수는 돼지 기준 조립체와 비교 가능한 93.1%이다. 또한 총 20,588개의 단백질 코딩 유전자, 8,651개의 비암호화 유전자, 반복 서열 요소 996.14 Mbp가 주석으로 달려 있다. NCMD 조립체는 돼지 기준 조립체의 다수의 공백(gap)을 메우는 데에도 활용되었다. 본 NCMD 조립체 및 주석은 돼지 및 관련 종의 게놈 분석을 위한 기반 자원을 제공한다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
BiologyCrossbreedGeneticsGenomeChromosomeGene
타입
article
IF / 인용수
5.8 / 8
게재 연도
2023

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