배경: 일본뇌염(Japanese encephalitis, JE)은 주로 백신 접종을 통해 효과적으로 통제되어 왔다. 그러나 2009년 중국에서 JE 바이러스(JE virus, JEV) 유전형 V(genotype V, GV)가 분리된 사실과, 2010년 이후 대한민국에서 JE 환자 수가 급격히 증가한 점은 새로운 도전 과제를 제기한다. 방법: 유전형 III(genotype III, GIII) 기반 JE 백신을 접종받은 개인의 혈청 시료를 분석하여 GV 분리주에 대한 중화 항체 혈청반응(중화성) 정도를 평가하였다. 결과: 불활성화 JE 백신을 접종한 면역저하 소아 환자의 혈청은 GIII Nakayama에 대해 50% 플라크 감소 중화검사(50% plaque reduction neutralization test) 기하평균 역가(geometric mean titer, GMT)가 11,358 (95% 신뢰구간 [CI], 1,790-29,658)로 더 높았으나, GV 분리주에 대해서는 더 낮은 GMT를 보였다: GV Muar 499 (95% CI, 0-2,437), GV 43279 308 (95% CI, 159-582), GV 43413 231 (95% CI, 108-738). 마찬가지로, 생(生)약독화 JE 백신을 접종받은 건강한 지원자 32명은 예방접종 후 1개월에 GIII Nakayama에 대해 100% 혈청보호(seroprotection)를 달성했으며, GMT는 338 (95% CI, 304-651)이었다. 그러나 GV 분리주에 대한 GMT는 GV Muar 123 (95% CI, 102-446), GV 43279 81 (95% CI, 63-168), GV 43413 107 (95% CI, 100-322)로, 이 분리주들에 대해서는 100% 혈청보호를 달성하지 못했다. 예방접종 후 6개월에는 Nakayama에 대한 GMT가 696 (95% CI, 409-2,353)으로 증가했으나, GV 분리주에 대해서는 유사한 수준을 유지했다. 결론: 본 연구는 현재의 GIII 기반 백신이 GV JEV에 대해 비슷한 수준의 보호를 제공하지 못함을 보여주며, 이는 현재 및 잠재적 풍토 지역의 개인뿐 아니라 이들 지역을 여행하는 사람들에게도 영향을 미친다.

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