원자력발전소에서 발생된 고준위방사성폐기물을 안전하게 관리하는 최적의 방안으로 심지층처분이 거론되고 있다. 심지층처분시스템 개념은 고준위방사성폐기물을 처분용기에 밀봉하여 지하 500 m 이하의 깊이에 위치한 처분공에 완충재와 함께 처분하는 것이다. 처분용기가 기능을 상실하게 되면 처분용기로부터 방사성 물질이 누출되어 지하 암반의 균열을 통해 생태계까지 도달할 수 있다. 따라서 지하암반 내 방사성 물질의 거동을 평가하기 위해서는 우선적으로 암반 내 균열특성을 명확히 파악하는 것이 중요하다. 본 연구에서는 자연상태의 균열이 있는 암반에 유체주입실험으로 얻은 수두 데이터를 이용하여 균열 내 간극의 크기를 평가하여 평균 간극은 0.102 mm 및 간극 체적은 61 mL를 도출하였다. 계산된 간극 분포를 3차원으로 형상화하여 유동 해석을 위한 격자를 생성하고 CFD 해석으로 간극 분포의 평가 방법을 검증하였다.