항생제 내성의 점진적인 증가는 전 세계 공중보건에 대한 우려스러운 위협을 제기한다. 항생제 내성은 인류 보건의 문제이지만, 동물과 환경이 인류 보건에 미치는 영향 때문에 항생제 내성에 대응하기 위한 ‘원헬스(One Health)’ 접근이 필요하다. 인류에서 항생제 내성이 확산되는 과정에서 동물과 환경이 미치는 영향을 정확히 추정하려면, 고품질의 과학적 근거가 요구된다. 예컨대 전장유전체 서열분석(whole-genome sequencing)과 같은 고해상도 기법을 통한 항생제 내성 세균의 분자 분석은, 항생제 내성을 유발하는 균주 또는 유전적 이동성 요소가 인간, 동물, 환경 사이에서 전파되는 양상을 조사하는 데 있어 신뢰할 만한 근거를 확보하는 데 적합하다. 본 논문에서는 인간, 동물, 환경에서 수집한 다양한 분리주에 whole-genome sequencing을 적용한 여러 관찰 연구를 논의한다. 이러한 분석들은 인류에서 항생제 내성의 확산에 대한 동물과 환경의 잠재적 위협을 정확히 평가하기 위해 whole-genome sequencing에 기반한 보다 광범위한 감시가 필요함을 시사하며, 더 높은 질의 근거를 확보하는 과정에서 발생하는 다양한 제한 사항을 극복하기 위한 노력이 필요함을 보여준다.

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