본 세부과제는 디지털 병리 기반의 암 전문 AI 분석 솔루션을 개발하는데 필요한 핵심 재료인 큰 규모이자 양질의 디지털 병리 데이터를 생산하는 것을 목적으로 함. 이 과제를 통해 1) 표준화된 고품질 디지털 병리 데이터를 생산할 것이며, 2) 디지털 병리 데이터와 임상정보가 통합된 데이터 셋을 확보하고 3) 이렇게 생산된 데이터 셋을 다룰 수 있는 뷰어와 ...
자궁내막암
자궁경부암
갑상선암
아노테이션
디지털병리
2
2021년 3월-2025년 12월
|500,000,000원
자궁암 및 갑상선암의 병리 데이터 디지털 큐레이션 기반 구축
본 세부과제는 디지털 병리 기반의 암 전문 AI 분석 솔루션을 개발하는데 필요한 핵심 재료인 큰 규모이자 양질의 디지털 병리 데이터를 생산하는 것을 목적으로 함. 이 과제를 통해 1) 표준화된 고품질 디지털 병리 데이터를 생산할 것이며, 2) 디지털 병리 데이터와 임상정보가 통합된 데이터 셋을 확보하고 3) 이렇게 생산된 데이터 셋을 다룰 수 있는 뷰어와 ...
자궁내막암
자궁경부암
갑상선암
아노테이션
디지털병리
3
주관|
2017년 2월-2019년 8월
|30,000,000원
담낭·담도암의 예후예측 및 표적약물치료를 위한 생체표지자 발굴
1차연도: 담낭·담도암 환자의 임상데이터를 수집하고 암조직의 병리학적 형태를 관찰, 이를 토대로 tissue microarray를 제작한다. 제작된 tissue microarray를 이용하여 DNA mismatch repair 유전자 (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2) 관련 단백질, RTK 관련 단백질 (FGFR2, ERBB2, EGFR, c-MET) 및 기타 알려진 유전자 변이 관련 단백질의 발현을 면역화학염색을 시행하여 확인하고, 그 결과를 분석한다.
2차연도: RTK 관련 유전자 중 FGFR2 은 FISH로 유전자 전위를 확인하고, HER2, EGFR, c-MET 의 유전자 증폭은 SISH로 확인한다. 현미부수체불안정성검사를 시행하여 DNA mismatch repair 유전자들의 유전자 변이를 확인한다. 각각의 검사로 얻어진 결과와 면역화학염색으로 확인한 유전자 변이 관련 단백질 발현과 비교 분석, 이들 면역화학염색방법의 유용성을 민감도 및 특이도를 구하여 확인한다.
3차연도: Targeted NGS 또는 MassARRAY iPLEX system을 이용하여 유전자 변이를 확인하고, 시행했던 면역화학염색, FISH, SISH 로 얻은 결과와 비교, 분석한다. 각 유전자 변이의 비율을 확인하고 임상병리학적 예후인자 들과의 상관관계를 분석하여, 면역화학염색법을 이용한 분자 분류를 만들고, 다른 기관의 담낭 및 담도암 조직을 이용하여 만들어진 분류의 적절성 및 유용성 확인한다.
1차연도: 담낭·담도암 환자의 임상데이터를 수집하고 암조직의 병리학적 형태를 관찰, 이를 토대로 tissue microarray를 제작한다. 제작된 tissue microarray를 이용하여 DNA mismatch repair 유전자 (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2) 관련 단백질, RTK 관련 단백질 (FGFR2, ERBB2, EGFR, c-MET) 및 기타 알려진 유전자 변이 관련 단백질의 발현을 면역화학염색을 시행하여 확인하고, 그 결과를 분석한다.
2차연도: RTK 관련 유전자 중 FGFR2 은 FISH로 유전자 전위를 확인하고, HER2, EGFR, c-MET 의 유전자 증폭은 SISH로 확인한다. 현미부수체불안정성검사를 시행하여 DNA mismatch repair 유전자들의 유전자 변이를 확인한다. 각각의 검사로 얻어진 결과와 면역화학염색으로 확인한 유전자 변이 관련 단백질 발현과 비교 분석, 이들 면역화학염색방법의 유용성을 민감도 및 특이도를 구하여 확인한다.
3차연도: Targeted NGS 또는 MassARRAY iPLEX system을 이용하여 유전자 변이를 확인하고, 시행했던 면역화학염색, FISH, SISH 로 얻은 결과와 비교, 분석한다. 각 유전자 변이의 비율을 확인하고 임상병리학적 예후인자 들과의 상관관계를 분석하여, 면역화학염색법을 이용한 분자 분류를 만들고, 다른 기관의 담낭 및 담도암 조직을 이용하여 만들어진 분류의 적절성 및 유용성 확인한다.