박해민 교수 연구실
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프로테오폼 해석을 위한 Top-down Proteomics 기술 고도화 방향 정리

Advances in top-down proteomics for proteoform analysis

연구 내용

Top-down proteomics에서 프로테오폼을 해석하기 위한 분리·이온화·단편화 및 데이터 처리 발전을 정리하는 연구

Top-down proteomics의 핵심은 단백질을 분해하지 않고 측정하여 proteoform을 규명하는 데 있습니다. 연구는 분리(separation), 이온화(ionization), 단편화(fragmentation) 조건이 proteoform 해석 가능성에 미치는 영향을 정리하고, 함께 요구되는 데이터 처리(data processing) 방법을 포괄합니다. 또한 proteoform-resolved 측정이 임상 및 전이 연구, 바이오테크놀로지 응용에서 제공하는 분자 메커니즘 해석의 이점을 구조적으로 설명하는 데 초점을 둡니다.

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연구 흐름

초기에는 bottom-up proteomics의 한계로 인해 발생하는 protein inference 문제를 기준으로 Top-down 접근의 필요성을 정리했습니다. 이어서 실험 구성 요소별로 분리, 이온화, 단편화 기술의 발전 양상을 정돈하고, proteoform 동정·정량을 위한 데이터 처리 파이프라인의 역할을 중심으로 확장했습니다. 최근에는 proteoform-resolved 측정이 임상 연구와 기술 개발에서 어떤 방식으로 활용되는지 사례 범위를 넓혀 종합적으로 정리하는 방향으로 진행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • 프로테오폼 기반 바이오마커 해석
  • 임상 전이 연구 분석 프레임
  • 단백질 수준 동정 체계
  • 분리-이온화-단편화 설계
  • proteoform-resolved 정량
  • 데이터 처리 알고리즘 선택
  • 단백질 변이 메커니즘 규명
  • 바이오테크 공정 분석
  • 연구용 LC-MS 전략 수립
  • 상용 분석 워크플로 구성

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Recent Advances in Top-Down Proteomics for Proteoform Analysis

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