전사 정지(transcriptional pause)는 모든 유형의 종결에 필수적이다. 세균의 Rho 인자 의존적 종결자에 대한 단일 분자(single-molecule) 연구에서, 우리는 단일 종결자 내에서 세 가지 Rho 의존적 종결 경로가 상호 양립 가능하게 작동함을 확인하였고, 또한 종결 효율이 예상과는 다른 방식으로 종결 정지(terminational pause)에 의존함을 발견하였다. 분명히 가장 풍부한 경로는 Rho가 새로 합성되는 RNA에 먼저 결합한 뒤 정지된 RNA 중합효소(RNAP)를 따라잡고(catch up), 이 따라잡기(catch-up) Rho가 RNAP로부터 전사된 RNA와 주형(template) DNA의 동시 방출을 매개한다는 것이다. 가장 빠른 경로는 따라잡기 Rho가 RNA만 방출을 유도하여 DNA 상에서 RNAP의 1D 재활용(1D recycling)을 일으키는 것이다. 가장 느린 경로는 RNAP가 선결합된(사전 결합된) 대기 스탠바이(stand-by) Rho가 순차적이 아니라 동시에 방출만을 촉진한다는 것이다. 세 경로 중에서, 스탠바이 Rho의 종결 효율만이 정지 지속 시간(pause duration)과 양의 상관관계를 보이며, 이는 오랫동안 제안되어 온 추측과는 반대로, NusA/NusG 인자, 경쟁(competing) RNA 또는 군집화(crowding) 물질의 부재 또는 존재 하에서도 일관되게 관찰된다. 그에 따라 필수적인 종결 정지는 따라잡기 Rho의 종결에 대해 반드시 길 필요가 없으며, 긴 정지는 오직 스탠바이 Rho의 종결에만 이익이 된다. 또한 mgtA 및 ribB 리보스위치의 Rho 의존적 종결은 주로 따라잡기 종료가 아니라 스탠바이의 조절에 의해 주도된다.

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