Single-molecule dynamics of R-loop formation at DNA damage during transcription and repair coupling
연구 내용
RNAP 단독 이동이 DSB에서 R-loop를 생성하는 과정을 단일분자로 추적하고, 복제 포크 회복에서 WRN의 올리고머 상태 변화를 함께 규명하는 DNA 손상 연동 전사 동역학 연구
활동성 전사는 DNA 이중가닥 절단 부위에서 R-loop를 형성하며, 이는 손상 복구 및 후속 전사 라운드에 영향을 줍니다. 본 연구는 단일분자 수준에서 E. coli RNAP의 전사만으로 DSB에서 R-loop가 생성되는지 확인하고, DNA end 구조가 형성 효율과 확장 양상에 미치는 영향을 정량적으로 비교합니다. R-loop는 DSB로부터 일방향으로 upstream으로 연장되며 다음 전사 개시를 방해하는 특성을 분석합니다. 또한 replication fork regression 맥락에서 WRN 헬리케이스의 올리고머 상태를 멀티컬러 단일분자 영상으로 측정하여 dimer- tetramer 전환이 활성과 연결됨을 해석합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
3편
관련 특허
0건
관련 프로젝트
2건
연구 흐름
2023년에는 전사 중인 RNAP가 단독으로 DSB에서 R-loop를 생성하는지 실험적으로 검증했습니다(2023). 이어 DNA end 구조에 따른 R-loop 형성 효율 차이와 bubble extension model에 부합하는 확장 특성을 제시했습니다(2023). 병행하여 손상 부위에서 공동전사 R-loop 형성을 관찰하는 단일분자 연구를 수행했습니다(2023). 한편 복구 연동의 복제 단계로 확장하여 WRN 헬리케이스가 forked DNA에서는 dimer로 결합하고, replication fork에서는 tetramer 결합 후 활성화 과정에서 dimer화됨을 규명했습니다(2022). 이를 통해 전사-손상-복구의 연결 고리를 동역학 관점에서 정리했습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Translocating RNA polymerase generates R-loops at DNA double-strand breaks without any additional factors
Single-molecule studies on co-transcriptional R-loop formation at DNA damage site
Werner syndrome protein works as a dimer for unwinding and replication fork regression
관련 프로젝트
구분
제목
DNA 손상 복구 비평형 동역학 연구실
DNA 손상 복구 비평형 동역학 연구실