홍성철 교수 연구실
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단일분자 형광 기반 핵산 바이오마커의 고속·고특이 정량 검출 연구

High-speed and specific quantification of nucleic-acid biomarkers using single-molecule fluorescence

연구 내용

형광 quenching kinetics와 다중화 단일분자 검출을 활용해 ctDNA·miRNA를 빠르고 민감하게 정량하는 분자진단 분석 연구

본 연구실은 핵산·단백질 바이오마커 검출에서 민감도와 특이도를 단일분자 수준에서 구현하는 분석 기술을 개발합니다. Q-FISH는 probe 결합의 형광 quenching kinetics를 기반으로 miRNA를 아단초 시간에 정량화하고, 매우 유사한 miRNA 간 차별과 내인성 miRNA 정량을 가능하게 합니다. 또한 다중화 단일분자 검출을 통해 circulating tumor DNA에서 변이를 빠르고 민감하게 검출하는 접근을 수행합니다. 더불어 단일분자 감도로 핵산·단백질을 검출하는 기술들을 liquid biopsy 관점에서 정리해 장단점과 설계 기준을 제시합니다.

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연구 흐름

검출 기술 스펙트럼을 정리하기 위해 단일분자 감도 기반 핵산·단백질 분석 기법을 비교하는 리뷰를 수행했습니다(2025). 이후 임상 적용 가능성을 목표로 ctDNA의 다중 단일분자 변이 검출을 구축했습니다(2023). 이후 프로브 결합 kinetics를 신호로 활용하는 Q-FISH를 도입하여 miRNA를 서브초 수준에서 정량화하는 기술을 제시했습니다(2026). 이러한 흐름은 단일분자 신호 해석을 기반으로 처리 시간을 줄이고 특이도를 확보하는 방향으로 일관되게 이어지고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • liquid biopsy용 ctDNA 변이 정량
  • miRNA 고속 감별 및 정량
  • 다중 바이오마커 패널 진단
  • 형광 quenching 기반 탐지 프로브 최적화
  • 서브초 핵산 프로파일링
  • 유사 서열 miRNA 차별 알고리즘
  • 단일분자 kinetics 기반 검출 특이도 향상
  • 분자진단용 고처리량 분석 파이프라인
  • 실험실 자동화용 시약·공정 설계
  • 약물 반응 모니터링 바이오마커 정량

관련 논문

구분

제목

1

Fast, sensitive, and specific multiplexed single-molecule detection of circulating tumor DNA

2

Analytical techniques for nucleic acid and protein detection with single-molecule sensitivity

3

Ultrafast and specific miRNA quantification via single-molecule fluorescence quenching kinetics

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