전사-연관 복구(transcription-coupled repair, TCR)와 R-루프는 전사 과정 동안 유전체 안정성을 유지하는 데 핵심적인 두 가지 상호 연관된 과정이다. 뉴클레오타이드 절제 복구(nucleotide excision repair)의 특화된 하위 경로인 TCR은, 활성 유전자의 전사되는 가닥에서 전사를 방해하는 병변을 신속히 제거함으로써 전사의 충실성 및 세포 항상성을 보호한다. 반면 R-루프는 전사 과정 중에 형성되는 RNA-DNA 하이브리드 구조로서 유전자 발현과 복제에서 조절 역할을 수행할 뿐 아니라, 지속적으로 축적될 경우 유전체 불안정성에 기여할 수도 있다. 최근의 실험적 증거는 TCR과 R-루프 해소(resolution) 경로 사이의 역동적인 상호작용(크로스토크)을 밝혀냈다. 본 고찰은 TCR과 R-루프 생물학에 대한 현재의 분자적·세포적 이해를 조명하고, 이들 크로스토크가 미치는 영향을 논의하며, 암 및 신경퇴행성 질환과 같은 상태에서 DNA 복구를 최적화하고 질병 위험을 감소시키기 위한 새롭게 부상하는 치료 전략을 탐색한다.
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