이성국 교수 연구실
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균주 발굴·유전체/단백질 수준 조절·AI 기반 설계를 통한 생물에너지/환경 분해 플랫폼 구축 연구

Strain Discovery, Genome/Proteome Regulation, and AI-Guided Design for Bioenergy and Environmental Degradation Platforms

연구 내용

균주 기반 기능을 규명하고 유전자 발현·번역·후기변형 조절 요소를 통합하며 AI 설계까지 활용해 생물에너지 및 BTEX 분해 플랫폼을 구축하는 연구

본 분야는 목적 기능을 갖는 미생물을 확보하고, 대사·조절 레벨에서 성능을 좌우하는 요소를 규명한 뒤 발현 시스템과 설계 방법을 결합하는 연구입니다. BTEX 분해를 수행하는 Cupriavidus cauae PHS1의 비교 유전체 분석을 통해 경로 특성을 파악하고, 생물학적 환경에서 작동 가능한 기능 요소를 찾습니다. 또한 chemoproteomics 기반으로 phosphohistidine 수용체와 같은 후기변형 조절 메커니즘을 확인해 탄소원 의존적 대사 제어를 설명합니다. 재조합 발현 벡터 설계와 함께 합성곱 신경망 기반의 인공지능 합성 미생물 연구가 연계됩니다.

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연구 흐름

초기에는 BTEX 분해 관련 열내성 Cupriavidus cauae 계통을 대상으로 비교 유전체 분석을 수행하여 분해 경로와 유전적 특징을 정리했습니다. 이후 생물학적 기능이 실제 대사 조절과 연결되는지를 이해하기 위해 chemoproteomics로 phosphohistidine 기반의 효소 조절 양상을 검토했습니다. 동시에 HpdR 전사인자와 관련 프로모터를 포함하는 재조합 발현 벡터를 설계해 E. coli와 Pseudomonas putida에서 발현 조절 가능성을 확보했습니다. 최근에는 바이오항공유용 슈도모나스 플랫폼 균주와 합성곱 신경망 기반 설계 과제로 확장되어, 균주 개발 속도를 높이는 방향으로 진행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • BTEX 분해 기능 기반 환경정화
  • 열내성 균주 활용 공정
  • 후기변형 기반 대사 제어 설계
  • chemoproteomics 기반 조절 타깃 발굴
  • 발현 벡터 모듈화
  • 수퍼 슈도모나스 플랫폼 균주
  • 바이오항공유 전구체 생산
  • 인공지능 합성 미생물 설계
  • 대사 경로-조절 요소 통합 최적화
  • 기능성 균주 육종 및 고도화

관련 논문

구분

제목

1

Comparative Genomic Analysis and BTEX Degradation Pathways of a Thermotolerant <i>Cupriavidus cauae</i> PHS1

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Comparative Genomic Analysis and BTEX Degradation Pathways of a Thermotolerant <i>Cupriavidus cauae</i> PHS1.

3

Chemoproteomic identification of phosphohistidine acceptors: posttranslational activity regulation of a key glycolytic enzyme

관련 특허

구분

제목

1

대장균 및 슈도모나스 푸티다에서 사용하기 위한 재조합 발현 시스템

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제목

1

바이오항공유 생산을 위한 수퍼 슈도모나스 플랫폼 균주 개발

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합성곱 신경망 기반 바이오 에너지 생산 기초 연구

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