Validation of functional microbiome groups via amplicon sequencing and targeted cultivation
연구 내용
증폭산물 서열분석과 표적 배양을 결합하여 새우 공생 및 해양 마이크로바이옴의 구성-기능 연계를 검증하는 연구
본 연구는 amplicon sequencing 기반 군집 조성 데이터를 먼저 확보한 후, 표적 배양(targeted cultivation)으로 특정 분류군 또는 기능군 후보를 실체화하는 전략을 사용합니다. 새우 공생 미생물 탐색에서는 양식 조건 변화에 따른 군집 구조 변동을 해석하고, 해양 마이크로바이옴 분석에서는 상호작용과 모사시스템을 통해 구성 요소의 검증 절차를 구성합니다. 이후 실제 양식 환경에서의 실증으로 이어지도록 설계하여, 관찰 기반 결과를 균주 자원 및 적용 기술로 전환하는 연결성을 확보합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
7편
관련 특허
0건
관련 프로젝트
8건
연구 흐름
초기에는 16S ribosomal RNA 기반의 군집 조성을 정리하고, 2020년 전후로 장내 분획 및 배양 조건에 따른 분류학적 차이를 확인했습니다. 동시에 2020~2022년에 해수·장내 유래 균주에서 신종·신속 제안을 수행해 분리 기반 근거를 축적했습니다. 2021년부터는 ‘증폭산물 서열분석-표적 배양-해양 마이크로바이옴 실증’ 흐름의 과제 수행으로 확장되어, 마린바이오틱스 관점에서 상호작용과 모사시스템 검증을 병행하는 방향으로 발전하고 있습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Effects of wheat flour and culture period on bacterial community composition in digestive tracts of Litopenaeus vannamei and rearing water in biofloc aquaculture system
Unveiling the Bacterial Community across the Stomach, Hepatopancreas, Anterior Intestine, and Posterior Intestine of Pacific Whiteleg Shrimp
Pukyongia salina gen. nov., sp. nov., a novel genus in the family Flavobacteriaceae
Pukyongiella litopenaei gen. nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from the gut content of a whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei
Rasiella rasia gen. nov. sp. nov. within the family Flavobacteriaceae isolated from seawater recirculating aquaculture system
Pikeienuella piscinae gen. nov., sp. nov., a novel genus in the family Rhodobacteraceae
<i>Microbacterium chionoecetis</i> sp. nov. and <i>Agrococcus chionoecetis</i> sp. nov.: Novel Gut Bacteria from Red Snow Crab
관련 프로젝트
구분
제목
증폭산물 서열분석 (Amplicon sequencing)과 표적 배양법(targeted cultivation)을 통한 새우 공생 및 양식 마이크로바이옴 연구
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해양생물 마이크로바이옴 분석, 확보, 검증 및 활용기술개발
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