본 과제는 콩 디지털 육종 실용화를 위해, 유전체 수준의 형질 정보를 분석해 분자 육종에 바로 쓰는 분석 플랫폼을 개발하는 연구임. 연구 목표는 요약문_연구목표 달성으로, SoyGWAS Catalog 모듈과 SoyPedi 고도화, CAPS/dCAPS/SSR 분자 마커 디자인·시각화 모듈을 구축하고 변이정보/전사체분석 모듈/GWAS Catalog/SoyPedi 통합을 통해 사용자 친화적 분자 마커 디자인 시스템 구현에 있음. 기대 효과는 육종 기간 단축과 유전체정보 기반 분자육종 플랫폼 실용화, 사용자 친화적 탐색을 통한 전문가 협업 증진, 주요 작물로 확장 가능성 제시에 있음.

본 과제는 주요 작물의 multiomics 정보를 한곳에 모으고 분석·시각화 도구로 연결해 유전체정보 기반 육종 설계 시스템을 구축하는 연구임. 연구목표는 다중 오믹스(multiomics) 정보의 집적/체계화, 분석 모듈 및 시각화 인터페이스 개발을 통한 유전체정보 기반의 육종 디자인 시스템 구축이며, 핵심 내용은 표준유전체 정보 집적/체계화로 Gbrowser 및 CGbrowser 구축, 해석유전체 데이터베이스(TGDB) 시스템과 전사체·물질대사 경로·유전자 상호작용 등 다중 오믹스 분석모듈 및 시각화 인터페이스 개발, TGDB 연동 G/CGbrowser 및 crossgenome 분석시스템, 콩 품종 통합 페디그리 및 phenome DB, 분자마커 디자인 자동화·마커 시각화 모듈 연동 고도화임. 기대효과는 정밀육종 구현, 형질연관 유전자·변이 발굴 기반 정밀 분자육종 마커 대량 개발, 육종가 친화적 오픈소스 플랫폼으로 유전체 육종 패러다임 저변 확대임.

본 과제는 두과작물 유전체정보를 모으고 데이터베이스와 분석도구로 엮어 역육종(reverse breeding)의 기반을 구축하는 연구임. 연구 목표는 콩 육종자원 통합 페디그리, 분자마커 디자인 시스템, translational functional annotation, pan-legume 해석유전체, 전사체·유전자네트웍·물질대사경로 모듈 연동을 통해 형질연관 중심 유전자와 종간장벽극복 유전자마커를 대량 발굴·육종 인터페이스화하는 것임. 기대효과는 학제 간 시너지와 Breeding-by- design 기반 마련, 육종 프로세스 가속 및 대량 마커/특허·논문 등 실용적 성과 창출임.

본 과제는 Translational genomics 인터페이스 구축을 통해 두과작물 유전체정보를 분자육종에 바로 연결하는 활용/실용화 플랫폼을 개발하는 연구임. 연구 목표는 두과작물 유전자 정보 통합 functional annotation, CSGM DesignerTGIL 연동 유전자마커 대량 디자인 시스템, 종간 ortholog 동정 알고리즘 최적화, 형질관련 유전자 기능별 탐색/집적화 및 DB 구축, GB/TOGDB/CGB 고도화 및 상호 연동화, 전사체-GenNet-MetaPath 모듈 통합분석 기반 형질연관 유전자 발굴, TOGDB 기반 panlegume 해석유전체 시스템 및 MetaPath/물질대사 연동 DB, 기능별 유전자네트웍(GenNet) 분석, 종간장벽극복 유전자마커 대량 디자인/개발 및 GAB 활용 인터페이스 구축에 있음. 기대효과는 두과작물 유전체 기반 분자육종 활용 인터페이스를 통한 유전체정보 실용성 확대, 형질연관 유전자의 대량 발굴 및 기능성 유전자마커 양산, Multiomics 기반 역육종 기술 기반 구축임.