SoyPedi 계보-표현형 연동 콩 품종 탐색 웹 인터페이스 및 데이터베이스 연구

SoyPedi Pedigree-Linked Web Interface for Soybean Cultivar Phenotypic Data

연구 내용

콩 품종의 가계도와 표현형 데이터를 연동해 탐색·비교가 가능하도록 웹 인터페이스와 데이터베이스를 구축하는 연구

Soybean 육종 설계에서 계보 기반 의사결정을 지원하기 위해, 품종 가계도와 표현형 데이터를 연동한 SoyPedi 데이터베이스 및 웹 인터페이스를 구축합니다. 통합 가계도와 표현형 데이터는 SQLite3, PHP, JavaScript 기반으로 구성하고, 가계도 지도 모듈과 표 형태 데이터 모듈을 단일 페이지 응용 방식으로 연결하여 사용자 탐색 흐름을 단순화합니다. 또한 whole genome resequencing 기반 phylogeny와 계보 간의 상관을 비교 분석하여 데이터의 일관성을 점검하고, 교배 조합 선택을 위한 실사용 지향 구조를 확보합니다.

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연구 흐름

초기에는 대두 품종의 가계도와 표현형 정보를 구조화하여 검색과 출력이 가능하도록 데이터 모델을 설계했습니다. 이후 SQLite3, PHP, JavaScript를 활용해 가계도 지도, 표 형태 데이터베이스, 품종 전용 웹 페이지로 구성된 모듈형 인터페이스를 구현했습니다. 다음 단계에서는 사용자 관점의 탐색 동선을 강화하기 위해 모듈 간 전환 방식을 단일 페이지 응용으로 연결하고, whole genome resequencing 기반 계통도와의 비교 분석을 통해 계보-표현형 연동의 해석 가능성을 검토했습니다. 최근에는 향후 데이터 확장성을 전제로 한 구조를 유지하며 육종 현장 활용도를 높이는 방향으로 정리되고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

계보 기반 교배 조합 탐색
표현형 데이터 검색
품종 전용 요약 페이지 제공
계통도-계보 상관 분석
표 형태 데이터 비교 기능
육종 의사결정 지원 대시보드
데이터 확장형 DB 구조
사용자 친화적 탐색 인터랙션
유전체 기반 품종 분류 보조
육종용 데이터 통합 저장소 구축