처리 대상수에 대해 무산소 조건 하에서 탈질 미생물에 의한 질소 제거가 이루어지는 무산소조;상기 무산소조로부터 배출되는 무산소조 배출수에 대해 혐기 조건 하에서 인축적 미생물에 의한 인 방출이 이루어지는 혐기조;상기 혐기조로부터 배출되는 혐기조 배출수의 pH를 측정하여 혐기조 배출수 pH 계측값을 출력하는 혐기조 pH 센서;상기 혐기조 배출수에 대해 호기 조건 하에서 인축적 미생물에 의한 인 과잉 섭취와 질산화 미생물에 의한 질소의 산화가 이루어지는 호기조;상기 호기조로부터 배출되는 호기조 배출수에 대한 호기 조건과 무산소조 조건 중 하나의 조건으로 선택적으로 운전하는 간헐폭기조;상기 간헐폭기조의 용존산소(DO)를 측정하여 계측 DO 농도를 출력하는 DO 센서;상기 간헐폭기조로 공기를 공급하는 간헐폭기조 송풍기;상기 간헐폭기조로부터 배출되는 간헐폭기조 배출수를 여과하여 처리하는 분리막 여과 장치를 구비하는 분리막조;상기 분리막 여과 장치로부터 배출되는 처리수의 pH를 측정하여 처리수 pH 계측값을 출력하는 처리수 pH 센서; 및암모니아성 질소(NH4+-N)의 산화정도와 pH 값의 변화량의 상관관계를 이용하여 상기 혐기조 배출수 pH 계측값과 상기 처리수 pH 계측값으로부터 상기 처리수의 암모니아성 질소(NH4+-N 농도)를 추정하여 상기 간헐폭기조 송풍기의 작동을 제어하는 제어부를 포함하며,상기 제어부는 상기 혐기조 배출수 pH 계측값에서 상기 처리수 pH 계측값을 뺀 값인 계측 ΔpH 값을 설정 ΔpH 값과 비교하며,상기 계측 ΔpH 값이 상기 설정 ΔpH 값보다 크지 않은 것으로 확인되고, 상기 계측 DO 농도가 설정 DO 농도보다 크지 않은 것으로 확인된 경우에, 상기 제어부는 상기 간헐폭기조 송풍기를 작동시키며,상기 계측 ΔpH 값이 상기 설정 ΔpH 값보다 크지 않은 것으로 확인되고, 상기 계측 DO 농도가 설정 DO 농도보다 큰 것으로 확인된 경우에, 상기 제어부는 상기 간헐폭기조 송풍기를 작동시키지 않는,수처리 시스템.